LIMA1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LIMA1编码肌动蛋白结合蛋白,参与细胞骨架调控,与结直肠癌等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LIMA1 |
|---|---|
| 基因全名 | LIM domain and actin binding 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q13.12 |
| NCBI Gene ID | 51474 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51474 |
| Ensembl ID | ENSG00000135446 |
| UniProt ID | Q9UHB6 |
| OMIM ID | 608330 |
| HGNC ID | 24533 |
| 基因别名 | EPLIN, SREBP3 |
基因功能与研究简介
LIMA1(LIM domain and actin binding 1)基因编码一种肌动蛋白结合蛋白,属于LIM蛋白家族。该蛋白在细胞骨架重塑、细胞迁移和粘附中发挥重要作用。LIMA1通过其LIM结构域和肌动蛋白结合域,参与调控肌动蛋白丝的组装和稳定,影响细胞形态和运动。研究表明,LIMA1在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | LIMA1表达下调与结直肠癌的进展和不良预后相关,可能通过影响细胞骨架和细胞粘附促进肿瘤侵袭。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | LIMA1在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤转移过程。 | 潜在关联 |
| 前列腺癌 | LIMA1表达变化与前列腺癌的进展有关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567delC (p.Leu189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LIMA1功能缺失突变可能导致细胞骨架调控异常,促进肿瘤进展。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明LIMA1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LIMA1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003779 (actin binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005856 (cytoskeleton) | • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization) |
相关通路
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• Focal adhesion (KEGG: hsa04510)
蛋白质功能简介
LIMA1蛋白由600个氨基酸组成,包含N端的LIM结构域和C端的肌动蛋白结合域。该蛋白通过与肌动蛋白丝结合,参与细胞骨架的稳定和重塑。LIMA1在细胞粘附、迁移和增殖中发挥重要作用,其表达异常与多种癌症相关。