LIMA1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LIMA1编码肌动蛋白结合蛋白,参与细胞骨架调控,与结直肠癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 LIMA1
基因全名 LIM domain and actin binding 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.12
NCBI Gene ID 51474 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51474
Ensembl ID ENSG00000135446
UniProt ID Q9UHB6
OMIM ID 608330
HGNC ID 24533
基因别名 EPLIN, SREBP3

基因功能与研究简介

LIMA1(LIM domain and actin binding 1)基因编码一种肌动蛋白结合蛋白,属于LIM蛋白家族。该蛋白在细胞骨架重塑、细胞迁移和粘附中发挥重要作用。LIMA1通过其LIM结构域和肌动蛋白结合域,参与调控肌动蛋白丝的组装和稳定,影响细胞形态和运动。研究表明,LIMA1在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 LIMA1表达下调与结直肠癌的进展和不良预后相关,可能通过影响细胞骨架和细胞粘附促进肿瘤侵袭。 较强研究证据
乳腺癌 LIMA1在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤转移过程。 潜在关联
前列腺癌 LIMA1表达变化与前列腺癌的进展有关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
前列腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LIMA1功能缺失突变可能导致细胞骨架调控异常,促进肿瘤进展。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LIMA1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LIMA1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003779 (actin binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005856 (cytoskeleton) • GO:0030036 (actin cytoskeleton organization)

相关通路

Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
Focal adhesion (KEGG: hsa04510)

蛋白质功能简介

LIMA1蛋白由600个氨基酸组成,包含N端的LIM结构域和C端的肌动蛋白结合域。该蛋白通过与肌动蛋白丝结合,参与细胞骨架的稳定和重塑。LIMA1在细胞粘附、迁移和增殖中发挥重要作用,其表达异常与多种癌症相关。

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