LIME1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

LIME1是一种参与T细胞信号转导的跨膜接头蛋白,在免疫调控中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 LIME1
基因全名 Lck interacting transmembrane adaptor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 20q13.33
NCBI Gene ID 54923 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54923
Ensembl ID ENSG00000101280
UniProt ID Q9H400
OMIM ID 609809
HGNC ID 26036
基因别名 LPHP, dJ583P15.4

基因功能与研究简介

LIME1(Lck interacting transmembrane adaptor 1)编码一种跨膜接头蛋白,主要在T细胞中表达,参与T细胞受体(TCR)信号通路的调控。LIME1通过其胞内ITAM样基序与Lck和Csk相互作用,调节T细胞活化。此外,LIME1在B细胞、NK细胞和肥大细胞中也有表达,参与多种免疫细胞的功能调控。研究表明,LIME1可能在某些癌症中异常表达,但其在肿瘤发生中的具体作用尚需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 目前尚无LIME1直接致病的明确证据,但可能参与免疫相关疾病和肿瘤的调控。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Jurkat T细胞 暂无可靠数据 T细胞系,LIME1高表达
Ramos B细胞 暂无可靠数据 B细胞系,LIME1表达
NK-92细胞 暂无可靠数据 NK细胞系,LIME1表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致LIME1蛋白功能丧失,影响T细胞信号转导,但具体疾病关联尚不明确。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强LIME1的抑制性信号,但尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰LIME1与Lck/Csk的相互作用,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007165 (signal transduction)
• GO:0002376 (immune system process)

相关通路

T cell receptor signaling pathway (KEGG: hsa04660)
B cell receptor signaling pathway (KEGG: hsa04662)

蛋白质功能简介

LIME1蛋白是一种跨膜接头蛋白,包含一个短的胞外区、一个跨膜区和一个较长的胞内区。胞内区含有ITAM样基序,能够与Lck和Csk相互作用,参与T细胞活化的负调控。LIME1在T细胞中高表达,在B细胞、NK细胞和肥大细胞中也有表达。其表达水平可能受到细胞活化状态的调节。

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