LIN7C基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LIN7C编码的蛋白质是细胞极性复合物的核心组分,参与突触传递和上皮细胞极性维持,其异常与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 LIN7C
基因全名 lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q14.1
NCBI Gene ID 55327 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55327
Ensembl ID ENSG00000149136
UniProt ID Q9NUP9
OMIM ID 612332
HGNC ID 18726
基因别名 LIN-7-C, MALS-3, VELI3, FLJ12476

基因功能与研究简介

LIN7C(lin-7 homolog C)是编码LIN-7蛋白家族成员之一的基因,该蛋白家族包含PDZ结构域,参与细胞极性复合物的组装。LIN7C蛋白与MALS/Veli家族成员及CASK相互作用,在神经元突触后密度和上皮细胞紧密连接中发挥关键作用。LIN7C通过维持细胞极性、调控突触传递和信号转导,参与神经系统的正常发育和功能。研究表明,LIN7C的异常表达或突变可能与神经发育障碍、精神分裂症以及某些癌症的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 LIN7C基因变异可能影响突触功能,增加精神分裂症风险。 有研究证据,但尚未明确致病
自闭症谱系障碍 LIN7C参与突触形成和维持,其异常可能与自闭症相关。 有研究证据,但尚未明确致病
乳腺癌 LIN7C在乳腺癌中表达下调,可能通过影响细胞极性促进肿瘤进展。 有研究证据,但尚未明确致病
结直肠癌 LIN7C表达异常与结直肠癌的侵袭和转移相关。 有研究证据,但尚未明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
Caco-2 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.208C>T (p.Arg70Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或相互作用
c.415G>A (p.Val139Met) 错义突变 罕见 可能影响PDZ结构域功能
c.532delC (p.Leu178SerfsTer23) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变导致截短蛋白,可能丧失功能,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LIN7C存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LIN7C存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0016020 (membrane) • GO:0030054 (cell junction)
• GO:0045202 (synapse) • GO:0007268 (chemical synaptic transmission)
• GO:0007155 (cell adhesion)

相关通路

hsa04530 (Tight junction)
hsa04724 (Glutamatergic synapse)
hsa04020 (Calcium signaling pathway)

蛋白质功能简介

LIN7C蛋白属于LIN-7家族,包含一个PDZ结构域和一个L27结构域。PDZ结构域介导与多种膜蛋白的相互作用,而L27结构域参与蛋白质复合物的组装。LIN7C与CASK、MALS-1等蛋白形成复合物,在神经元突触后密度中富集,参与受体和离子通道的锚定。在上皮细胞中,LIN7C定位于紧密连接,维持细胞极性和屏障功能。LIN7C的异常可能导致突触功能障碍和细胞极性丧失,从而参与疾病发生。

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