LMO2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LMO2是T细胞发育和血管生成的关键转录调控因子,其异常表达与T细胞急性淋巴细胞白血病密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LMO2 |
|---|---|
| 基因全名 | LIM domain only 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p13 |
| NCBI Gene ID | 4005 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4005 |
| Ensembl ID | ENSG00000135363 |
| UniProt ID | P25791 |
| OMIM ID | 180385 |
| HGNC ID | 6642 |
| 基因别名 | RBTN2, TTG2, RBTNL1 |
基因功能与研究简介
LMO2(LIM domain only 2)基因编码一个含有两个LIM结构域的转录调控因子,在造血干细胞、T细胞和B细胞发育以及血管生成中发挥关键作用。LMO2作为转录复合物的桥梁分子,与TAL1、GATA1等转录因子相互作用,调控靶基因表达。LMO2的异常表达(如染色体易位或逆转录病毒插入)可导致T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| T细胞急性淋巴细胞白血病 | LMO2异常表达(如染色体易位t(11;14)(p13;q11)或逆转录病毒插入)导致其异位表达,干扰T细胞分化,促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤 | LMO2在部分血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤中高表达,可能参与疾病发生,但具体机制尚不完全清楚。 | 具有较强研究证据 |
| 其他癌症 | LMO2在部分实体瘤(如乳腺癌、前列腺癌)中表达异常,但关联性尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达于造血干细胞和祖细胞 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | T细胞发育中表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | B细胞和T细胞区域表达 |
| 血管内皮 | 暂无可靠数据 | 血管生成中表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系,LMO2高表达 |
| MOLT-4 | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系,LMO2高表达 |
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 人脐静脉内皮细胞,LMO2表达参与血管生成 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| t(11;14)(p13;q11) | 染色体易位 | 罕见 | 导致LMO2异位表达,激活致癌程序 |
| 逆转录病毒插入 | 插入突变 | 罕见 | 导致LMO2异常表达,见于基因治疗临床试验中 |
| 错义突变 | 点突变 | 罕见 | 功能影响尚不明确,可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LMO2功能缺失突变在人类疾病中罕见,但动物模型显示Lmo2缺失导致造血和血管发育缺陷。
Gain of Function(功能获得,GOF)
LMO2的异常表达(如易位或插入)属于功能获得性改变,促进T细胞白血病发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LMO2存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) | • GO:0007507 (heart development) |
| • GO:0030097 (hemopoiesis) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
相关通路
• TAL1 transcription factor network
• Notch signaling pathway
• Hematopoietic stem cell differentiation
蛋白质功能简介
LMO2蛋白由158个氨基酸组成,含有两个LIM结构域(LIM1和LIM2),这些结构域介导蛋白-蛋白相互作用。LMO2本身不直接结合DNA,而是作为转录复合物的桥梁,与TAL1、GATA1、LDB1等形成复合体,调控靶基因表达。在造血细胞中,LMO2对红系和巨核细胞分化至关重要;在T细胞中,其异常表达可导致白血病。
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