LONRF3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LONRF3编码一种含有LON蛋白酶底物识别结构域的E3泛素连接酶,参与蛋白质质量控制与细胞应激反应,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 LONRF3
基因全名 LON peptidase N-terminal domain and ring finger 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xq24
NCBI Gene ID 79836 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79836
Ensembl ID ENSG00000124491
UniProt ID Q5T6F2
OMIM ID 300490
HGNC ID 21186
基因别名 RNF127, LONRF3

基因功能与研究简介

LONRF3基因编码一种含有LON蛋白酶底物识别结构域和RING指结构域的E3泛素连接酶。该蛋白定位于细胞质,可能参与蛋白质质量控制、细胞应激反应和泛素-蛋白酶体途径。LONRF3在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中较高。研究表明LONRF3可能参与神经发育和突触功能,其突变与X连锁智力障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
X连锁智力障碍 LONRF3基因突变可能导致蛋白功能丧失,影响神经元发育和突触可塑性,从而引起智力障碍。 ClinVar收录致病性变异,OMIM关联
自闭症谱系障碍 部分LONRF3变异在自闭症患者中被发现,但证据尚不充分,需进一步研究。 ClinVar收录意义未明变异
癌症 LONRF3在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 COSMIC数据库收录体细胞突变

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短
c.456_457del (p.Glu153fs) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短
c.789A>G (p.Ile263Val) 错义突变 未知 可能影响蛋白功能,需进一步验证
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致蛋白表达减少或功能缺失,与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LONRF3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LONRF3存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Protein processing in endoplasmic reticulum (KEGG: hsa04141)

蛋白质功能简介

LONRF3蛋白由约700个氨基酸组成,包含N端LON底物识别结构域和C端RING指结构域。作为E3泛素连接酶,LONRF3可能通过泛素化底物参与蛋白质降解调控。研究表明LONRF3在神经元中表达,可能调节突触蛋白的稳态。

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