LOXL3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LOXL3编码赖氨酰氧化酶样蛋白3,参与细胞外基质交联,与遗传性脊柱侧凸及多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 LOXL3
基因全名 Lysyl oxidase like 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p13.1
NCBI Gene ID 84695 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84695
Ensembl ID ENSG00000115310
UniProt ID P58215
OMIM ID 607163
HGNC ID 13856
基因别名 LOXL3, lysyl oxidase-like 3, LOXL

基因功能与研究简介

LOXL3基因编码赖氨酰氧化酶样蛋白3,属于赖氨酰氧化酶家族,该家族成员催化胶原蛋白和弹性蛋白中赖氨酸残基的氧化脱氨,形成交联,从而稳定细胞外基质。LOXL3在多种组织中表达,尤其在软骨、心脏和胎盘中高表达。研究表明LOXL3参与细胞外基质重塑、细胞迁移和肿瘤进展。LOXL3突变与遗传性脊柱侧凸相关,其异常表达与多种癌症的预后相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性脊柱侧凸 LOXL3基因突变导致编码蛋白功能异常,影响胶原交联,导致脊柱结构异常。 已明确致病
乳腺癌 LOXL3在乳腺癌中高表达,可能促进肿瘤侵袭和转移。 具有较强研究证据
结直肠癌 LOXL3表达上调与结直肠癌的进展和不良预后相关。 具有较强研究证据
黑色素瘤 LOXL3在黑色素瘤中表达增加,可能参与肿瘤微环境重塑。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
软骨 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
胎盘 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
SK-MEL-28 暂无可靠数据 黑色素瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1234G>A (p.Gly412Ser) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1567C>T (p.Arg523Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致LOXL3蛋白功能丧失或减弱,可能引起细胞外基质交联异常,与遗传性脊柱侧凸相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明LOXL3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明LOXL3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005507 (copper ion binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0005615 (extracellular space)
• GO:0005507 (copper ion binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0005615 (extracellular space)

相关通路

ECM-receptor interaction (hsa04512)
Focal adhesion (hsa04510)
PI3K-Akt signaling pathway (hsa04151)

蛋白质功能简介

LOXL3蛋白属于赖氨酰氧化酶家族,含有铜离子结合位点和赖氨酰氧化酶结构域。该蛋白在细胞外基质中催化胶原蛋白和弹性蛋白的交联,对维持组织完整性至关重要。LOXL3还参与细胞信号传导和基因表达调控,影响细胞增殖、迁移和分化。

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