LRAT基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LRAT基因编码卵磷脂视黄醇酰基转移酶,在维生素A代谢和视觉循环中发挥关键作用,其突变可导致视网膜营养不良等疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | LRAT |
|---|---|
| 基因全名 | lecithin retinol acyltransferase (phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q32.1 |
| NCBI Gene ID | 9227 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9227 |
| Ensembl ID | ENSG00000121207 |
| UniProt ID | P42771 |
| OMIM ID | 604863 |
| HGNC ID | 6698 |
| 基因别名 | Lecithin retinol acyltransferase; RBP4 receptor; RP20 |
基因功能与研究简介
LRAT基因编码卵磷脂视黄醇酰基转移酶,该酶催化视黄醇(维生素A)与磷脂酰胆碱的酯化反应,生成视黄醇酯,是维生素A代谢和储存的关键步骤。在视觉循环中,LRAT将视黄醇转化为视黄醇酯,供视网膜色素上皮细胞利用,以维持视循环的正常功能。LRAT基因突变可导致多种视网膜疾病,如Leber先天性黑蒙(LCA)和视网膜色素变性(RP)。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Leber先天性黑蒙(Leber congenital amaurosis) | LRAT基因突变导致酶活性丧失,影响视黄醇酯的合成,进而干扰视觉循环,导致视网膜感光细胞进行性退化。 | 已明确致病 |
| 视网膜色素变性(Retinitis pigmentosa) | LRAT基因突变可导致常染色体隐性遗传的视网膜色素变性,表现为夜盲和视野缩小。 | 已明确致病 |
| 早发性视网膜营养不良(Early-onset retinal dystrophy) | LRAT基因突变与早发性视网膜营养不良相关,症状包括视力下降和视网膜电图异常。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结肠腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.262T>C (p.Cys88Arg) | 错义突变 | 罕见 | 导致酶活性丧失,与Leber先天性黑蒙相关 |
| c.394C>T (p.Arg132Ter) | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能丧失,导致视网膜色素变性 |
| c.161A>G (p.Tyr54Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,与视网膜营养不良相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数LRAT突变导致酶活性丧失或蛋白功能缺失,属于功能缺失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明LRAT存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LRAT存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004099 (lecithin-retinol acyltransferase activity) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0006629 (lipid metabolic process) | • GO:0007601 (visual perception) |
相关通路
• Retinol metabolism (hsa00830)
• Vitamin A metabolism
• Visual cycle
蛋白质功能简介
LRAT蛋白是一种内质网跨膜酶,属于酰基转移酶家族。它催化视黄醇与磷脂酰胆碱的酯化反应,生成视黄醇酯,储存于视网膜色素上皮细胞中。LRAT在视觉循环中起关键作用,其功能缺失导致视黄醇供应不足,影响视紫红质再生,最终导致感光细胞死亡。
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