LRBA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LRBA基因编码一种参与膜泡运输和自噬调控的蛋白质,其突变与免疫缺陷和自身免疫疾病密切相关。

基因信息卡

基因符号 LRBA
基因全名 LPS responsive beige-like anchor protein
基因类型 protein coding
染色体位置 4q31.3
NCBI Gene ID 987 ncbi.nlm.nih.gov/gene/987
Ensembl ID ENSG00000138449
UniProt ID P50851
OMIM ID 606453
HGNC ID 1742
基因别名 BGL, CDC4L, LBA, beige-like protein

基因功能与研究简介

LRBA基因编码LPS反应性beige样锚定蛋白,该蛋白参与膜泡运输、自噬调控和受体信号传导。LRBA蛋白通过调控细胞毒性T淋巴细胞相关抗原4(CTLA-4)的胞内运输,影响免疫应答。LRBA基因突变可导致LRBA缺乏症,表现为原发性免疫缺陷和自身免疫性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
LRBA缺乏症 LRBA基因突变导致CTLA-4运输异常,引起免疫失调,表现为免疫缺陷、自身免疫和炎症性疾病。 已明确致病
常见变异型免疫缺陷病(CVID) LRBA突变是CVID的遗传病因之一,导致B细胞功能缺陷和抗体产生减少。 已明确致病
自身免疫性肠病 LRBA缺乏可导致调节性T细胞功能异常,引发肠道自身免疫炎症。 具有较强研究证据
淋巴增殖性疾病 LRBA缺乏与淋巴增殖和淋巴瘤风险增加相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
B淋巴细胞 暂无可靠数据 LRBA在B细胞中高表达
T淋巴细胞 暂无可靠数据 LRBA在T细胞中表达
自然杀伤细胞 暂无可靠数据 LRBA在NK细胞中表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.5161C>T (p.Arg1721Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.862C>T (p.Arg288Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.2458delC (p.Leu820TrpfsTer3) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LRBA基因的失功能突变(如无义、移码)导致蛋白功能丧失,是LRBA缺乏症的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LRBA存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LRBA突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0006886 intracellular protein transport
• GO:0006914 autophagy • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005768 endosome • GO:0005794 Golgi apparatus

相关通路

hsa04140 Autophagy - animal
hsa04650 Natural killer cell mediated cytotoxicity
hsa04672 Intestinal immune network for IgA production

蛋白质功能简介

LRBA蛋白是一种大型胞质蛋白,包含多个结构域,包括BEACH结构域和WD40重复序列。它参与膜泡运输,特别是调控CTLA-4从内体到细胞表面的再循环。LRBA通过维持CTLA-4的正常表达,调节T细胞活化。此外,LRBA还参与自噬过程,影响细胞稳态。

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