LRRC47基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LRRC47编码富含亮氨酸重复序列的蛋白质,参与细胞凋亡和DNA损伤应答,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LRRC47 |
|---|---|
| 基因全名 | leucine rich repeat containing 47 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.32 |
| NCBI Gene ID | 10261 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10261 |
| Ensembl ID | ENSG00000162571 |
| UniProt ID | Q8N1G4 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:29395 |
| 基因别名 | DKFZp686K168, FLJ14800, MGC117215 |
基因功能与研究简介
LRRC47基因编码富含亮氨酸重复序列的蛋白质,该蛋白定位于细胞核和细胞质,参与细胞凋亡和DNA损伤应答。研究表明LRRC47在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因发挥作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | LRRC47在肝细胞癌中表达下调,可能通过调控细胞凋亡影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | LRRC47在结直肠癌中表达异常,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | LRRC47在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝细胞癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致蛋白截短,可能丧失功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
| • GO:0006974 (DNA damage response) |
相关通路
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
LRRC47蛋白包含多个富含亮氨酸重复序列,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明该蛋白在细胞凋亡和DNA损伤应答中发挥作用,但其具体分子机制尚不完全清楚。