LRRC47基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LRRC47编码富含亮氨酸重复序列的蛋白质,参与细胞凋亡和DNA损伤应答,与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 LRRC47
基因全名 leucine rich repeat containing 47
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.32
NCBI Gene ID 10261 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10261
Ensembl ID ENSG00000162571
UniProt ID Q8N1G4
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:29395
基因别名 DKFZp686K168, FLJ14800, MGC117215

基因功能与研究简介

LRRC47基因编码富含亮氨酸重复序列的蛋白质,该蛋白定位于细胞核和细胞质,参与细胞凋亡和DNA损伤应答。研究表明LRRC47在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 LRRC47在肝细胞癌中表达下调,可能通过调控细胞凋亡影响肿瘤进展。 较强研究证据
结直肠癌 LRRC47在结直肠癌中表达异常,与肿瘤分期和预后相关。 较强研究证据
乳腺癌 LRRC47在乳腺癌中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝细胞癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.R152*) 无义突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变导致蛋白截短,可能丧失功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006915 (apoptotic process)
• GO:0006974 (DNA damage response)

相关通路

Apoptosis (KEGG: hsa04210)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

LRRC47蛋白包含多个富含亮氨酸重复序列,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。研究表明该蛋白在细胞凋亡和DNA损伤应答中发挥作用,但其具体分子机制尚不完全清楚。

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