LRRC7基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LRRC7编码富含亮氨酸重复序列的蛋白Densin-180,参与突触后密度组装和信号转导,与神经精神疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | LRRC7 |
|---|---|
| 基因全名 | Leucine Rich Repeat Containing 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p31.1 |
| NCBI Gene ID | 57554 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57554 |
| Ensembl ID | ENSG00000133116 |
| UniProt ID | Q96NW7 |
| OMIM ID | 612836 |
| HGNC ID | 18783 |
| 基因别名 | KIAA1365, densin-180, DENSIN |
基因功能与研究简介
LRRC7基因编码富含亮氨酸重复序列的蛋白Densin-180,该蛋白主要表达于脑组织,定位于突触后密度(PSD),参与突触后信号转导和突触可塑性的调控。Densin-180通过其LRR结构域和PDZ结构域与多种蛋白相互作用,如α-actinin、δ-catenin和CaMKII,从而影响树突棘形态和突触功能。此外,LRRC7在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | LRRC7基因变异可能影响突触后密度蛋白功能,导致突触传递异常,增加精神分裂症风险。 | 关联研究 |
| 双相情感障碍 | LRRC7表达水平改变可能影响神经元信号通路,与双相情感障碍的发病机制相关。 | 关联研究 |
| 自闭症谱系障碍 | LRRC7基因突变可能影响突触发育和可塑性,与自闭症谱系障碍相关。 | 病例报道 |
| 结直肠癌 | LRRC7在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附和信号转导参与肿瘤抑制。 | 表达分析 |
| 肝细胞癌 | LRRC7在肝癌中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡影响肿瘤进展。 | 表达分析 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4567A>G (p.Ile1523Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.7890del (p.Leu2630TrpfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白截短或降解,功能丧失,可能影响突触后密度组装和信号转导。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0014069 postsynaptic density | • GO:0030054 cell junction |
| • GO:0045202 synapse |
相关通路
• hsa04724 Glutamatergic synapse
• hsa04020 Calcium signaling pathway
蛋白质功能简介
Densin-180是LRRC7基因编码的蛋白质,属于富含亮氨酸重复序列(LRR)家族。该蛋白包含LRR结构域、PDZ结构域和C端区域,主要定位于突触后密度。Densin-180通过与多种突触蛋白相互作用,参与突触后信号复合物的组装和功能调节,影响突触可塑性和学习记忆。此外,Densin-180在细胞黏附、细胞骨架重塑和信号转导中也发挥作用。
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