LRRK2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LRRK2是帕金森病最重要的遗传风险基因之一,其突变与家族性和散发性帕金森病密切相关,是药物研发和基因治疗的热门靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | LRRK2 |
|---|---|
| 基因全名 | Leucine-rich repeat kinase 2 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 12q12 |
| NCBI Gene ID | 120892 ncbi.nlm.nih.gov/gene/120892 |
| Ensembl ID | ENSG00000188906 |
| UniProt ID | Q5S007 |
| OMIM ID | 609007 |
| HGNC ID | 18682 |
| 基因别名 | PARK8, DARDARIN, AURA17 |
基因功能与研究简介
LRRK2基因编码富亮氨酸重复激酶2(dardarin),属于Roco蛋白家族,包含激酶域和GTPase域。该基因广泛表达于脑、肺、肾等组织,参与调控突触囊泡运输、自噬、线粒体功能等。LRRK2突变是常染色体显性遗传帕金森病(PARK8)最常见的病因,其中G2019S突变在特定人群中频率较高。此外,LRRK2变异也与散发性帕金森病、克罗恩病及麻风病等存在关联。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病(Parkinson disease) | LRRK2突变导致激酶活性增强或GTPase功能异常,影响多巴胺能神经元存活,导致帕金森病。 | 已明确致病 |
| 克罗恩病(Crohn disease) | LRRK2基因变异(如M2397T)与克罗恩病风险相关,可能通过影响自噬和炎症通路。 | 具有较强研究证据 |
| 麻风病(Leprosy) | LRRK2变异与麻风病易感性相关,可能涉及免疫调节。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,常用于帕金森病研究 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系,常用于蛋白表达研究 |
| U937 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系,用于免疫相关研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| G2019S | 错义突变 | 家族性帕金森病中约4%,散发性中约1% | 激酶活性增强,功能获得性突变 |
| R1441C/G/H | 错义突变 | 家族性帕金森病中约1-2% | GTPase活性降低,可能影响激酶活性 |
| Y1699C | 错义突变 | 罕见 | GTPase域突变,功能影响尚不明确 |
| I2020T | 错义突变 | 罕见 | 激酶域突变,功能影响尚不明确 |
| M2397T | 错义突变 | 克罗恩病相关 | 可能影响自噬功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LRRK2激酶活性丧失突变(如激酶域失活突变)可能导致功能缺失,但临床致病性尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
G2019S等突变增强激酶活性,导致毒性功能获得,是帕金森病的主要致病机制。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分GTPase域突变可能通过显性负效应干扰正常蛋白功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0003924 (GTPase activity) |
| • GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005768 (endosome) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0006914 (autophagy) |
| • GO:0016020 (membrane) | • GO:0030424 (axon) |
| • GO:0045202 (synapse) |
相关通路
• hsa05012 (Parkinson disease)
• hsa04140 (Autophagy - animal)
• hsa04010 (MAPK signaling pathway)
• hsa04668 (TNF signaling pathway)
蛋白质功能简介
LRRK2蛋白由2527个氨基酸组成,包含多个功能域:N端锚蛋白重复域、富含亮氨酸重复域、Ras相关GTPase域、C端激酶域和WD40重复域。该蛋白主要定位于细胞质,参与囊泡运输、自噬、线粒体动态等过程。LRRK2激酶活性异常是帕金森病发病的关键,因此LRRK2激酶抑制剂成为治疗帕金森病的研究热点。
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