LSG1基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

LSG1编码核糖体生物发生关键GTP酶,调控60S核糖体亚基成熟,其异常与癌症及发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 LSG1
基因全名 large 60S subunit nuclear export GTPase 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q29
NCBI Gene ID 55337 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55337
Ensembl ID ENSG00000114771
UniProt ID Q9H089
OMIM ID 617681
HGNC ID 25572
基因别名 FLJ12735, FLJ14115, hLsg1

基因功能与研究简介

LSG1基因编码一个属于GTP酶家族的蛋白质,该蛋白质在核糖体生物发生中发挥关键作用,特别是参与60S核糖体亚基的成熟和核输出。LSG1通过水解GTP为核糖体亚基的运输提供能量,确保核糖体正确组装。研究表明,LSG1的异常表达与多种癌症相关,可能通过影响蛋白质合成速率促进肿瘤发生。此外,LSG1突变可能导致核糖体生物发生缺陷,进而引发发育异常。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 LSG1在多种癌症中高表达,可能通过促进核糖体生物发生和蛋白质合成来支持肿瘤细胞增殖。 较强研究证据
发育障碍 LSG1突变可能导致核糖体生物发生缺陷,影响胚胎发育,但具体机制尚待阐明。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000A>G (p.Thr334Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响GTP酶活性,导致功能异常
c.1501C>T (p.Arg501Ter) 无义突变 暂无可靠数据 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使LSG1功能丧失,影响核糖体成熟。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明LSG1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

某些错义突变可能产生显性负效应,干扰正常LSG1功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005525 (GTP binding) • GO:0003924 (GTPase activity)
• GO:0006364 (rRNA processing) • GO:0042254 (ribosome biogenesis)
• GO:0005730 (nucleolus)

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
Nuclear export of 60S ribosomal subunit (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

LSG1蛋白属于GTP酶家族,定位于核仁,参与核糖体60S亚基的成熟和核输出。它通过结合并水解GTP,为核糖体亚基的运输提供能量。LSG1的异常表达或突变可能影响核糖体生物发生,进而导致蛋白质合成异常,与癌症和发育障碍相关。

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