LSM10基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LSM10是U7 snRNP复合物的核心组分,参与组蛋白前体mRNA的3'末端加工,对细胞周期调控和基因组稳定性至关重要。

基因信息卡

基因符号 LSM10
基因全名 LSM10 homolog, U7 small nuclear RNA associated
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p34.3
NCBI Gene ID 84967 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84967
Ensembl ID ENSG00000182004
UniProt ID Q9Y468
OMIM ID 610514
HGNC ID 26262
基因别名 HSPC182, MST074, PPP1R131

基因功能与研究简介

LSM10基因编码U7 snRNP复合物的一个核心蛋白,该复合物在细胞核中参与组蛋白前体mRNA的3'末端加工,对细胞周期S期的组蛋白合成至关重要。LSM10蛋白与LSM11蛋白形成异二聚体,与U7 snRNA结合,共同构成U7 snRNP。该复合物通过识别组蛋白前体mRNA下游的茎环结构,招募CPSF复合物等加工因子,完成3'末端的切割和多聚腺苷酸化(组蛋白mRNA通常不进行多聚腺苷酸化,而是形成茎环结构)。LSM10的功能异常可能导致组蛋白mRNA加工缺陷,影响细胞周期和基因组稳定性,与某些癌症和发育异常相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) LSM10表达异常可能影响组蛋白mRNA加工,导致细胞周期失调和基因组不稳定,促进肿瘤发生。 较强研究证据
发育异常 LSM10功能缺失可能影响胚胎发育过程中组蛋白的合成,导致发育异常。 潜在关联
暂无明确致病性突变 目前尚无明确证据表明LSM10突变直接导致特定遗传病。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.200delA (p.Asn67ThrfsTer19) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型突变):导致LSM10蛋白功能部分或完全丧失,影响U7 snRNP复合物的组装或活性,进而干扰组蛋白mRNA加工。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前尚无明确证据表明LSM10存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前尚无明确证据表明LSM10存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006397 (mRNA processing) • GO:0008334 (histone mRNA metabolic process)
• GO:0030620 (U7 snRNA binding)

相关通路

Histone mRNA 3' end processing (Reactome: R-HSA-77588)

蛋白质功能简介

LSM10蛋白是U7 snRNP复合物的核心组分,与LSM11形成异二聚体,与U7 snRNA结合。该复合物在细胞核中识别组蛋白前体mRNA的3'端茎环结构,并招募CPSF复合物等因子,完成3'末端的切割和加工。LSM10蛋白包含Sm-like结构域,参与RNA结合和蛋白-蛋白相互作用。其表达水平在细胞周期中受到调控,在S期达到高峰,以支持组蛋白的大量合成。

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