LSM14A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LSM14A是P小体核心组分,参与mRNA降解与翻译调控,在神经发育和癌症中具有潜在作用。

基因信息卡

基因符号 LSM14A
基因全名 LSM14A homolog, mRNA degradation associated
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.11
NCBI Gene ID 26065 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26065
Ensembl ID ENSG00000105699
UniProt ID Q9UMS4
OMIM ID 610677
HGNC ID 16662
基因别名 RAP55, C19ORF13

基因功能与研究简介

LSM14A(LSM14A homolog, mRNA degradation associated)编码一种RNA结合蛋白,属于LSm(Sm-like)蛋白家族。该蛋白是P小体(processing bodies)的核心组分,参与mRNA的脱帽、降解和翻译抑制等过程。LSM14A在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,LSM14A在神经发育、应激颗粒形成和病毒感染中发挥重要作用。此外,LSM14A的异常表达与某些癌症相关,但其具体机制尚待深入研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确致病性突变 暂无明确证据表明LSM14A突变直接导致遗传病。 暂无可靠数据
癌症(潜在关联) LSM14A在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控mRNA稳定性影响肿瘤相关基因表达,但具体机制尚不明确。 研究证据有限,多为表达谱分析
神经系统疾病(潜在关联) LSM14A在脑组织中高表达,可能参与神经元mRNA代谢,与神经发育或退行性疾病相关,但缺乏直接证据。 研究证据有限

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA-seq和免疫组化)
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
SH-SY5Y 暂无可靠数据 内源性表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性或功能,但无明确致病性证据
c.456C>T (p.Ser152Leu) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合能力,但无明确致病性证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致LSM14A蛋白表达减少或功能丧失,影响mRNA降解和翻译调控,但目前在疾病中未见明确致病性证据。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强LSM14A的活性,但尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常蛋白功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0000932 P-body
• GO:0006402 mRNA catabolic process • GO:0032925 translational regulation

相关通路

mRNA surveillance pathway (Reactome: R-HSA-975957)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA (Reactome: R-HSA-72203)

蛋白质功能简介

LSM14A蛋白由445个氨基酸组成,包含一个N端的LSm结构域和一个C端的RGG基序。该蛋白定位于细胞质P小体,参与mRNA的脱帽和降解过程。LSM14A通过其LSm结构域结合RNA,并通过与DCP1/DCP2等脱帽因子相互作用,促进mRNA降解。此外,LSM14A还参与应激颗粒的形成,在应激条件下保护mRNA。在细胞中,LSM14A的敲低会导致P小体数量减少,影响mRNA代谢。

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