LSM2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LSM2是U6 snRNP和mRNA降解复合体的核心组分,参与RNA代谢,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 LSM2
基因全名 LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p21.31
NCBI Gene ID 57819 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57819
Ensembl ID ENSG00000114520
UniProt ID Q9Y333
OMIM ID 607562
HGNC ID 20458
基因别名 C6orf28, YBL026W, MDS017

基因功能与研究简介

LSM2基因编码Sm样蛋白家族成员,是U6 snRNP和mRNA降解复合体的核心组分。该蛋白参与pre-mRNA剪接、mRNA降解和RNA代谢调控。LSM2突变可能导致神经发育障碍,如智力障碍和发育迟缓。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 LSM2突变导致蛋白功能异常,影响RNA代谢,进而干扰神经发育。 ClinVar
智力障碍 LSM2突变与常染色体隐性遗传的智力障碍相关。 OMIM
发育迟缓 LSM2突变导致整体发育迟缓,包括运动和语言发育。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.95A>G (p.Asp32Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.196C>T (p.Arg66Trp) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合
c.238_239del (p.Leu80fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变和部分错义突变导致蛋白功能丧失,影响RNA代谢。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome
• GO:0005634 nucleus • GO:0005681 spliceosomal complex
• GO:0006402 mRNA catabolic process • GO:0031012 extracellular matrix

相关通路

hsa03040 Spliceosome
hsa03018 RNA degradation

蛋白质功能简介

LSM2蛋白是Sm样蛋白家族成员,包含Sm motif,参与U6 snRNP组装和mRNA降解。该蛋白在RNA代谢中发挥关键作用,其突变可能导致神经发育障碍。

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