LSM5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LSM5是U6 snRNP和mRNA降解复合体的核心组分,参与RNA代谢,其突变可能导致神经系统疾病。

基因信息卡

基因符号 LSM5
基因全名 LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 7p14.3
NCBI Gene ID 23658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23658
Ensembl ID ENSG00000106355
UniProt ID Q9Y4Y9
OMIM ID 607576
HGNC ID 17162
基因别名 YER146W

基因功能与研究简介

LSM5基因编码Sm样蛋白家族成员,是U6 snRNP和mRNA降解复合体的核心组分。该蛋白参与前体mRNA剪接、mRNA降解和RNA代谢调控。LSM5在多种组织中表达,其功能异常与神经发育疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致LSM5蛋白功能丧失或减弱,可能影响RNA代谢。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负效突变:目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 mRNA splicing • via spliceosome
• GO:0005634 nucleus • GO:0005681 spliceosomal complex
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0006402 mRNA catabolic process
• GO:0030015 CCR4-NOT complex

相关通路

Spliceosome (hsa03040)
RNA degradation (hsa03018)

蛋白质功能简介

LSM5蛋白属于Sm样蛋白家族,包含Sm motif,参与U6 snRNP组装和mRNA降解。该蛋白与LSM2、LSM3、LSM4、LSM6、LSM7、LSM8等形成复合体,在RNA代谢中发挥重要作用。

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