LTB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
LTB基因编码淋巴毒素β,是肿瘤坏死因子超家族成员,在免疫系统发育和炎症反应中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | LTB |
|---|---|
| 基因全名 | lymphotoxin beta |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p21.33 |
| NCBI Gene ID | 4050 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4050 |
| Ensembl ID | ENSG00000227507 |
| UniProt ID | Q06643 |
| OMIM ID | 600978 |
| HGNC ID | 6711 |
| 基因别名 | TNF-C, TNFC, LT-beta, lymphotoxin beta |
基因功能与研究简介
LTB基因编码淋巴毒素β(LTβ),是肿瘤坏死因子超家族(TNFSF)成员。LTβ主要作为膜结合蛋白表达,与淋巴毒素α(LTα)形成异源三聚体(LTα1β2),参与淋巴组织发育、免疫应答和炎症反应。LTβ通过与其受体(LTβR)结合,激活NF-κB信号通路,调控趋化因子和细胞因子的表达。LTB基因突变与免疫缺陷和自身免疫性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷 | LTB基因突变导致LTβ功能缺失,影响淋巴组织发育和免疫应答,可能导致免疫缺陷。 | ClinVar |
| 自身免疫性疾病 | LTB基因多态性与类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病相关。 | OMIM |
| 癌症 | LTB在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤微环境调控,但具体机制尚在研究中。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞系 |
| Raji | 暂无可靠数据 | B细胞系 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Arg152*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789delC (p.Leu264fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
LTB基因的失功能突变(如无义突变、移码突变)导致LTβ蛋白缺失或功能丧失,影响免疫系统发育和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明LTB基因存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明LTB基因存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005125 (cytokine activity) | • GO:0005164 (tumor necrosis factor receptor binding) |
| • GO:0005615 (extracellular space) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0006955 (immune response) | • GO:0007165 (signal transduction) |
相关通路
• hsa04060 (Cytokine-cytokine receptor interaction)
• hsa04668 (TNF signaling pathway)
• hsa04672 (Intestinal immune network for IgA production)
蛋白质功能简介
LTβ蛋白是肿瘤坏死因子超家族成员,主要作为膜结合蛋白表达。它与LTα形成异源三聚体(LTα1β2),通过结合LTβ受体(LTβR)激活NF-κB信号通路,调控趋化因子和细胞因子的表达,参与淋巴组织发育和免疫应答。LTβ在免疫细胞中高表达,对维持免疫稳态至关重要。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID | |
|---|---|---|---|---|
| LTBP4基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ6235 | 人 | 8425 | 详情 立即询价 |
| LTBP2基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ5149 | 人 | 4053 | 详情 立即询价 |
| CLTB基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ4295 | 人 | 1212 | 详情 立即询价 |
| LTB4R基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ4301 | 人 | 1241 | 详情 立即询价 |
| LTBP3基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ2270 | 人 | 4054 | 详情 立即询价 |
| LTBP1基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ389 | 人 | 4052 | 详情 立即询价 |
| LTB基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ572 | 人 | 4050 | 详情 立即询价 |
| LTBR基因敲除HEK293细胞 | EDJ-KQ573 | 人 | 4055 | 详情 立即询价 |
| LTBP1基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ17982 | 人 | 4052 | 详情 立即询价 |
| LTBR基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ18968 | 人 | 4055 | 详情 立即询价 |
| LTBP3基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ22611 | 人 | 4054 | 详情 立即询价 |
| CLTB基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ26783 | 人 | 1212 | 详情 立即询价 |
| LTB4R基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ26790 | 人 | 1241 | 详情 立即询价 |
| LTBP2基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ26888 | 人 | 4053 | 详情 立即询价 |
| LTBP4基因敲除HCT116细胞 | EDJ-KQ30082 | 人 | 8425 | 详情 立即询价 |
Displaying Records 1 To 15 Of 36 Records
- 1
- 2
- Next Page »