LYAR基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LYAR是一种参与核糖体生物发生和细胞增殖调控的锌指蛋白,在多种癌症中异常表达,是潜在的肿瘤治疗靶点。

基因信息卡

基因符号 LYAR
基因全名 Ly1 antibody reactive
基因类型 protein-coding
染色体位置 4p16.3
NCBI Gene ID 55646 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55646
Ensembl ID ENSG00000138668
UniProt ID Q9HBJ8
OMIM ID 617684
HGNC ID 16896
基因别名 LYAR, ZC2HC2A, MLF1IP

基因功能与研究简介

LYAR(Ly1 antibody reactive)基因编码一种含C2HC型锌指结构的核仁蛋白,参与核糖体RNA加工、细胞增殖调控和DNA损伤应答。LYAR在多种肿瘤中高表达,与不良预后相关,可能通过调控核糖体生物发生和p53信号通路促进肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性髓系白血病 LYAR在AML中高表达,可能通过促进核糖体生物发生和抑制分化参与白血病发生。 较强研究证据
肝细胞癌 LYAR在肝癌中过表达,与肿瘤增殖和转移相关,可能通过调控细胞周期和凋亡。 较强研究证据
乳腺癌 LYAR在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过影响雌激素受体信号通路。 潜在关联
结直肠癌 LYAR在结直肠癌中高表达,可能通过促进Wnt/β-catenin信号通路。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 罕见 可能影响锌指结构,导致功能异常
c.456_457insA (p.Thr153Asnfs*5) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

LYAR功能缺失突变可能导致核糖体生物发生异常,影响细胞增殖,但具体致病性尚需研究。

Gain of Function(功能获得,GOF)

LYAR过表达或功能获得性突变可能促进肿瘤发生,但具体突变类型尚未明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LYAR存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0003676 nucleic acid binding
• GO:0006364 rRNA processing • GO:0008283 cell population proliferation
• GO:0006974 DNA damage response

相关通路

核糖体生物发生通路 (Ribosome biogenesis)
p53信号通路 (p53 signaling pathway)
Wnt信号通路 (Wnt signaling pathway)

蛋白质功能简介

LYAR蛋白是一种核仁锌指蛋白,包含一个C2HC型锌指结构域和一个核定位信号。它参与核糖体RNA的加工和核糖体亚基的组装,调控细胞增殖和凋亡。LYAR还通过与p53相互作用影响DNA损伤应答,并在多种肿瘤中高表达,促进肿瘤进展。

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