LYSMD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

LYSMD1是一种参与细胞凋亡调控的蛋白,其功能异常可能与癌症等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 LYSMD1
基因全名 LysM domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q32.1
NCBI Gene ID 144568 ncbi.nlm.nih.gov/gene/144568
Ensembl ID ENSG00000143157
UniProt ID Q96EH3
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:27063
基因别名 LYSMD1, C1orf128, FLJ20254

基因功能与研究简介

LYSMD1(LysM domain containing 1)基因编码一种含有LysM结构域的蛋白质,该结构域通常参与细菌细胞壁肽聚糖的结合,但在人类中其功能尚不完全清楚。研究表明LYSMD1可能参与细胞凋亡的调控,通过影响线粒体途径或死亡受体途径发挥作用。LYSMD1在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中表达较高。目前,LYSMD1的突变与特定疾病的直接关联尚未明确,但一些研究提示其可能在某些癌症中表达异常,如乳腺癌和肺癌。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(乳腺癌、肺癌) 潜在关联:LYSMD1表达异常可能影响细胞凋亡,促进肿瘤发生发展。 研究证据:部分研究显示LYSMD1在肿瘤组织中表达下调或上调,但机制尚不明确。
暂无明确疾病关联 暂无可靠数据 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
胎盘 暂无可靠数据 高表达(根据GTEx)
其他组织 暂无可靠数据 低至中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 表达水平未知
MCF7 暂无可靠数据 表达水平未知
A549 暂无可靠数据 表达水平未知
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 未知 可能影响蛋白结构,但功能影响未明
c.456C>T (p.Pro152Leu) 错义突变 未知 可能影响蛋白稳定性,但功能影响未明
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明LYSMD1突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明LYSMD1突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明LYSMD1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0006915 (apoptotic process)

相关通路

暂无明确通路数据

蛋白质功能简介

LYSMD1蛋白含有LysM结构域,该结构域在细菌中参与肽聚糖结合,但在人类中可能具有不同的功能。研究表明LYSMD1可能定位于细胞质,并参与凋亡调控。其具体分子机制尚待阐明。

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