MACROH2A1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

MACROH2A1编码组蛋白变体macroH2A1,参与基因转录调控、DNA损伤修复和染色质结构维持,与多种癌症及发育过程相关。

基因信息卡

基因符号 MACROH2A1
基因全名 macroH2A.1 histone
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.1
NCBI Gene ID 9555 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9555
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID O75367
OMIM ID 602597
HGNC ID 4744
基因别名 H2AFY, macroH2A1.1, macroH2A1.2

基因功能与研究简介

MACROH2A1基因编码组蛋白变体macroH2A1,属于H2A组蛋白家族。macroH2A1包含一个N端的组蛋白折叠结构域和一个C端的macro结构域,后者可结合NAD+代谢物。该蛋白在染色质中富集于转录沉默区域,参与X染色体失活、基因印记、DNA损伤修复和衰老调控。MACROH2A1通过选择性剪接产生两个主要亚型:macroH2A1.1和macroH2A1.2,两者在macro结构域上存在差异,功能上有所区别。研究表明,MACROH2A1在多种癌症中表达异常,影响肿瘤增殖、侵袭和转移,同时也在细胞衰老和炎症反应中发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 MACROH2A1在多种癌症中表达失调,如肝癌、乳腺癌、肺癌等。其表达水平与肿瘤分期、预后相关,可能通过调控基因转录和DNA修复影响肿瘤发生发展。 较强研究证据
发育异常 MACROH2A1参与胚胎发育和细胞分化,其异常表达可能导致发育缺陷,但具体致病机制尚不明确。 潜在关联
衰老相关疾病 MACROH2A1在细胞衰老过程中表达上调,可能参与衰老相关疾病的发生,如动脉粥样硬化等。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.456_457insA (p.Thr153Asnfs*2) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):某些突变导致蛋白截短或结构破坏,可能使macroH2A1功能丧失,影响染色质调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前尚无明确证据表明MACROH2A1突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):某些突变可能干扰野生型蛋白功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006334 (nucleosome assembly) • GO:0006342 (chromatin silencing)
• GO:0006281 (DNA repair)

相关通路

hsa03440 (Homologous recombination)
hsa03430 (Mismatch repair)
hsa04218 (Cellular senescence)

蛋白质功能简介

macroH2A1蛋白是组蛋白H2A的变体,包含组蛋白折叠结构域和macro结构域。它参与染色质结构的调控,通过影响核小体稳定性来调节基因转录。macroH2A1在DNA损伤修复中发挥作用,可能通过招募修复因子或改变染色质状态。此外,macroH2A1与细胞衰老相关,其表达在衰老细胞中升高。

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