MADCAM1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
MADCAM1编码黏膜地址素细胞黏附分子1,是淋巴细胞归巢至黏膜组织的关键分子,参与炎症和自身免疫疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | MADCAM1 |
|---|---|
| 基因全名 | mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19p13.3 |
| NCBI Gene ID | 8174 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8174 |
| Ensembl ID | ENSG00000120688 |
| UniProt ID | P19320 |
| OMIM ID | 102670 |
| HGNC ID | 6768 |
| 基因别名 | MAdCAM-1, MADCAM-1 |
基因功能与研究简介
MADCAM1基因编码黏膜地址素细胞黏附分子1(MAdCAM-1),属于免疫球蛋白超家族。该蛋白主要表达于肠道相关淋巴组织(如Peyer's patches)的高内皮微静脉(HEV)表面,通过与淋巴细胞上的整合素α4β7结合,介导淋巴细胞向黏膜组织的定向归巢。MAdCAM-1在炎症条件下表达上调,参与炎症性肠病、自身免疫性疾病等病理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 炎症性肠病 | MAdCAM-1介导淋巴细胞向肠道炎症部位浸润,促进炎症反应 | 较强研究证据 |
| 溃疡性结肠炎 | MAdCAM-1在结肠炎症组织中高表达,与疾病活动性相关 | 较强研究证据 |
| 克罗恩病 | MAdCAM-1表达增加,参与肠道炎症的淋巴细胞募集 | 较强研究证据 |
| 原发性硬化性胆管炎 | MAdCAM-1在肝脏和肠道表达异常,可能参与疾病发病 | 潜在关联 |
| 多发性硬化 | MAdCAM-1在脑内皮细胞表达,可能参与免疫细胞浸润 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 人脐静脉内皮细胞 | 暂无可靠数据 | 可诱导表达 |
| 肠微血管内皮细胞 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 淋巴内皮细胞 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs2301734 | SNP | 未知 | 可能影响MAdCAM-1表达或功能,与炎症性肠病相关 |
| rs758926 | SNP | 未知 | 可能影响MAdCAM-1表达,与溃疡性结肠炎相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005615 (extracellular space) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (hsa04514)
• Hematopoietic cell lineage - Homo sapiens (human) (hsa04640)
蛋白质功能简介
MAdCAM-1是一种跨膜糖蛋白,由胞外区、跨膜区和胞内区组成。胞外区包含一个N端免疫球蛋白样结构域和一个黏蛋白样结构域,可与整合素α4β7结合。该蛋白主要表达于黏膜相关淋巴组织的高内皮微静脉,介导淋巴细胞归巢。在炎症条件下,其表达上调,促进免疫细胞浸润。