MDC1基因|基因功能、疾病关联、突变与DNA损伤修复研究
MDC1是DNA损伤应答中的关键衔接蛋白,介导γH2AX信号传导,维持基因组稳定性,其异常与肿瘤发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | MDC1 |
|---|---|
| 基因全名 | mediator of DNA damage checkpoint 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6p21.33 |
| NCBI Gene ID | 9656 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9656 |
| Ensembl ID | ENSG00000137337 |
| UniProt ID | Q14676 |
| OMIM ID | 602667 |
| HGNC ID | 6970 |
| 基因别名 | NFBD1; MGC17173; DKFZp686B10109 |
基因功能与研究简介
MDC1(mediator of DNA damage checkpoint 1)是DNA损伤应答(DDR)中的关键衔接蛋白。在DNA双链断裂(DSB)发生后,MDC1通过其BRCT结构域与组蛋白H2AX磷酸化形式(γH2AX)结合,并招募下游修复因子如53BP1和BRCA1,促进同源重组(HR)和非同源末端连接(NHEJ)修复。MDC1还参与细胞周期检查点激活,维持基因组稳定性。MDC1表达异常或突变与多种肿瘤的发生发展相关,是癌症研究的重要靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | MDC1表达下调或功能缺失导致DNA损伤修复缺陷,增加基因组不稳定性,促进乳腺癌发生。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | MDC1在肺癌组织中表达异常,与肿瘤分期和预后相关。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | MDC1基因多态性可能与结直肠癌易感性相关。 | 潜在关联 |
| 卵巢癌 | MDC1表达水平与卵巢癌化疗敏感性相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2960C>T (p.Pro987Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.4336A>G (p.Thr1446Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响BRCT结构域功能 |
| c.6943C>T (p.Arg2315Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
MDC1功能缺失突变导致DNA损伤修复缺陷,细胞对电离辐射敏感,基因组不稳定。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明MDC1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分截短突变可能干扰野生型MDC1功能,产生显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0035861 (site of double-strand break) |
相关通路
• Homologous recombination (Reactome: R-HSA-5693567)
• Nonhomologous end-joining (Reactome: R-HSA-5693568)
• p53-dependent G1 DNA damage response (Reactome: R-HSA-69541)
蛋白质功能简介
MDC1蛋白由2089个氨基酸组成,包含N端的FHA结构域和C端的BRCT结构域。FHA结构域介导与MDC1自身磷酸化或与其他蛋白的相互作用,BRCT结构域与γH2AX结合。MDC1在DNA损伤后迅速磷酸化,作为支架蛋白招募下游因子,放大DNA损伤信号。MDC1还参与端粒维持和免疫球蛋白类别转换重组。
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