MEX3D基因|RNA结合蛋白功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

MEX3D是一种RNA结合蛋白,参与mRNA代谢调控,与多种癌症和神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 MEX3D
基因全名 mex-3 RNA binding family member D
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.3
NCBI Gene ID 399664 ncbi.nlm.nih.gov/gene/399664
Ensembl ID ENSG00000181588
UniProt ID Q5FVE4
OMIM ID 611879
HGNC ID 24517
基因别名 RKHD3, MEX3D, RING finger and KH domain containing 3

基因功能与研究简介

MEX3D(mex-3 RNA binding family member D)是一种RNA结合蛋白,属于MEX3家族。该蛋白含有两个N端KH结构域和一个C端RING finger结构域,参与mRNA的转录后调控,包括mRNA的稳定性、翻译和定位。MEX3D在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明MEX3D参与细胞增殖、凋亡和分化等过程,并与多种癌症(如肝癌、乳腺癌)和神经系统疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 MEX3D在肝癌中高表达,可能通过调控mRNA稳定性促进肿瘤进展。 较强研究证据
乳腺癌 MEX3D在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关。 较强研究证据
结直肠癌 MEX3D在结直肠癌中表达异常,可能参与肿瘤发生。 潜在关联
神经系统疾病 MEX3D在脑组织中高表达,可能参与神经元发育和功能,但具体疾病关联尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA和蛋白水平)
睾丸 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明
c.456C>T (p.S152F) 错义突变 罕见 可能影响RNA结合能力
c.789delC (p.L263fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响mRNA调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

某些错义突变可能增强蛋白稳定性或改变底物特异性,但证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明MEX3D突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 RNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005634 nucleus
• GO:0006397 mRNA processing • GO:0006417 regulation of translation

相关通路

hsa03018 RNA degradation
hsa04120 Ubiquitin mediated proteolysis

蛋白质功能简介

MEX3D蛋白由596个氨基酸组成,包含两个N端KH结构域(负责RNA结合)和一个C端RING finger结构域(具有E3泛素连接酶活性)。该蛋白主要定位于细胞质,参与mRNA的稳定性调控和翻译抑制。MEX3D通过与靶mRNA的3'UTR结合,招募CCR4-NOT复合物或促进mRNA脱腺苷化,从而加速mRNA降解。此外,MEX3D还可能通过泛素化途径降解底物蛋白,参与细胞周期和凋亡的调控。

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