MKRN3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

MKRN3是青春期启动的关键抑制因子,其功能缺失突变导致家族性中枢性性早熟。

基因信息卡

基因符号 MKRN3
基因全名 Makorin Ring Finger Protein 3
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 15q11.2
NCBI Gene ID 7681 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7681
Ensembl ID ENSG00000139187
UniProt ID Q13064
OMIM ID 603856
HGNC ID 7114
基因别名 RNF63, ZNF127

基因功能与研究简介

MKRN3基因编码一种含有锌指结构域和RING指结构域的E3泛素连接酶,属于makorin家族。该基因位于染色体15q11.2的Prader-Willi综合征关键区域,仅父源等位基因表达(母源印记)。MKRN3在多种组织中表达,尤其在脑组织中高表达,参与调控蛋白质泛素化降解。研究表明MKRN3是青春期启动的抑制因子,其功能缺失突变导致家族性中枢性性早熟(familial central precocious puberty)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
家族性中枢性性早熟 MKRN3功能缺失突变导致青春期启动提前,机制涉及解除对GnRH神经元的抑制,但具体分子通路尚不完全明确。 已明确致病(OMIM 176400)
中枢性性早熟(散发性) 部分散发性中枢性性早熟患者中检测到MKRN3突变,但频率较低。 具有较强研究证据
Prader-Willi综合征 MKRN3位于PWS关键区域,但PWS主要由SNRPN等基因缺失导致,MKRN3单倍剂量不足可能贡献部分表型,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脑(下丘脑) 暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序和免疫组化)
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
卵巢 暂无可靠数据 中等表达
肾上腺 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
神经母细胞瘤细胞系(SH-SY5Y) 暂无可靠数据 内源性表达
人胚胎肾细胞(HEK293) 暂无可靠数据 常用于外源表达研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.482C>T (p.Pro161Leu) 错义突变 罕见 功能缺失(影响E3连接酶活性)
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 功能缺失(蛋白质合成受阻)
c.238C>T (p.Arg80*) 无义突变 罕见 功能缺失(截短蛋白)
c.331G>A (p.Gly111Arg) 错义突变 罕见 功能缺失(影响锌指结构)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

MKRN3突变导致功能缺失,即蛋白质活性降低或丧失,无法正常发挥抑制青春期启动的作用,从而引发性早熟。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明MKRN3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明MKRN3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
• GO:0008270 (zinc ion binding) • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Protein processing in endoplasmic reticulum (KEGG: hsa04141)

蛋白质功能简介

MKRN3蛋白由507个氨基酸组成,包含一个C3H4型锌指结构域、一个C3HC4型RING指结构域和一个makorin型锌指结构域。作为E3泛素连接酶,MKRN3参与底物蛋白的泛素化修饰,从而调控其降解或活性。在青春期启动中,MKRN3在下丘脑表达,抑制GnRH的释放,其功能缺失导致青春期提前。

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