MKS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

MKS1基因编码基体定位蛋白,参与纤毛形成,其突变与Meckel综合征、Joubert综合征等纤毛病相关。

基因信息卡

基因符号 MKS1
基因全名 Meckel syndrome, type 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q22
NCBI Gene ID 54903 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54903
Ensembl ID ENSG00000111144
UniProt ID Q5T6S3
OMIM ID 609883
HGNC ID 7121
基因别名 MKS; FLJ20345; MKS1; BBS13; POC12

基因功能与研究简介

MKS1基因编码一种基体定位蛋白,是纤毛形成和功能所必需的。该蛋白参与纤毛内运输(IFT)和基体成熟过程。MKS1基因突变可导致多种纤毛病,包括Meckel综合征1型、Joubert综合征等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Meckel综合征1型 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛形成异常,影响胚胎发育,导致多囊肾、脑膨出、多指等畸形。 已明确致病(OMIM)
Joubert综合征 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛信号通路异常,影响小脑和脑干发育,表现为小脑蚓部发育不良、呼吸异常等。 已明确致病(OMIM)
Bardet-Biedl综合征13型 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛功能异常,影响视网膜、肾脏、四肢等发育,表现为视网膜色素变性、肥胖、多指等。 已明确致病(OMIM)
COACH综合征 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛异常,影响小脑、肝脏、肾脏等发育,表现为小脑蚓部发育不良、肝纤维化、肾囊肿等。 具有较强研究证据(OMIM)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
hTERT-RPE1 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞,常用于纤毛研究
IMR90 暂无可靠数据 成纤维细胞,常用于纤毛研究
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1408C>T (p.Arg470Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.926G>A (p.Trp309Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失
c.1189G>A (p.Gly397Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,具体机制待研究
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):MKS1基因的截短突变或剪接位点突变导致蛋白功能丧失,是Meckel综合征等疾病的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明MKS1基因存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明MKS1基因突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005813 (centrosome) • GO:0005929 (cilium)
• GO:0036064 (ciliary basal body) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

Ciliopathy (HP:0000118)
Hedgehog signaling pathway (GO:0007224)

蛋白质功能简介

MKS1蛋白定位于纤毛基体,参与基体成熟和纤毛形成。它可能作为支架蛋白,参与纤毛内运输复合物(IFT)的组装。MKS1蛋白的缺失或功能异常会导致纤毛结构或功能缺陷,进而引发多种纤毛病。

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