MKS1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
MKS1基因编码基体定位蛋白,参与纤毛形成,其突变与Meckel综合征、Joubert综合征等纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | MKS1 |
|---|---|
| 基因全名 | Meckel syndrome, type 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q22 |
| NCBI Gene ID | 54903 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54903 |
| Ensembl ID | ENSG00000111144 |
| UniProt ID | Q5T6S3 |
| OMIM ID | 609883 |
| HGNC ID | 7121 |
| 基因别名 | MKS; FLJ20345; MKS1; BBS13; POC12 |
基因功能与研究简介
MKS1基因编码一种基体定位蛋白,是纤毛形成和功能所必需的。该蛋白参与纤毛内运输(IFT)和基体成熟过程。MKS1基因突变可导致多种纤毛病,包括Meckel综合征1型、Joubert综合征等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Meckel综合征1型 | 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛形成异常,影响胚胎发育,导致多囊肾、脑膨出、多指等畸形。 | 已明确致病(OMIM) |
| Joubert综合征 | 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛信号通路异常,影响小脑和脑干发育,表现为小脑蚓部发育不良、呼吸异常等。 | 已明确致病(OMIM) |
| Bardet-Biedl综合征13型 | 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛功能异常,影响视网膜、肾脏、四肢等发育,表现为视网膜色素变性、肥胖、多指等。 | 已明确致病(OMIM) |
| COACH综合征 | 致病机制:MKS1基因突变导致纤毛异常,影响小脑、肝脏、肾脏等发育,表现为小脑蚓部发育不良、肝纤维化、肾囊肿等。 | 具有较强研究证据(OMIM) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| hTERT-RPE1 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞,常用于纤毛研究 |
| IMR90 | 暂无可靠数据 | 成纤维细胞,常用于纤毛研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1408C>T (p.Arg470Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.926G>A (p.Trp309Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1189G>A (p.Gly397Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,具体机制待研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):MKS1基因的截短突变或剪接位点突变导致蛋白功能丧失,是Meckel综合征等疾病的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明MKS1基因存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明MKS1基因突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0036064 (ciliary basal body) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• Ciliopathy (HP:0000118)
• Hedgehog signaling pathway (GO:0007224)
蛋白质功能简介
MKS1蛋白定位于纤毛基体,参与基体成熟和纤毛形成。它可能作为支架蛋白,参与纤毛内运输复合物(IFT)的组装。MKS1蛋白的缺失或功能异常会导致纤毛结构或功能缺陷,进而引发多种纤毛病。