MSH6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
MSH6是DNA错配修复系统的关键成员,其突变与Lynch综合征及多种肿瘤的发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | MSH6 |
|---|---|
| 基因全名 | mutS homolog 6 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2p16.3 |
| NCBI Gene ID | 2956 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2956 |
| Ensembl ID | ENSG00000116062 |
| UniProt ID | P52701 |
| OMIM ID | 600678 |
| HGNC ID | 7329 |
| 基因别名 | ['GTBP', 'HNPCC5', 'MSH-6', 'p160'] |
基因功能与研究简介
MSH6基因编码DNA错配修复(MMR)系统的关键蛋白MutS homolog 6。该蛋白与MSH2形成异二聚体(MutSα),识别并启动修复DNA复制过程中产生的碱基错配和插入/缺失环。MSH6功能缺陷导致基因组不稳定,增加癌症风险。MSH6胚系突变是Lynch综合征(遗传性非息肉病性结直肠癌)的常见原因之一,体细胞突变也见于多种散发性肿瘤。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Lynch综合征 | MSH6胚系致病性突变导致DNA错配修复缺陷,引起微卫星不稳定,显著增加结直肠癌、子宫内膜癌等风险。 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | MSH6体细胞突变或启动子甲基化导致MMR功能缺失,参与肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 子宫内膜癌 | MSH6突变是Lynch综合征相关子宫内膜癌的常见原因,也见于散发性病例。 | 已明确致病 |
| 胃癌 | MSH6缺陷与微卫星不稳定相关,可能增加胃癌风险。 | 具有较强研究证据 |
| 卵巢癌 | MSH6突变与Lynch综合征相关卵巢癌风险增加有关。 | 具有较强研究证据 |
| 其他癌症 | MSH6突变可能与其他癌症(如胰腺癌、前列腺癌)风险相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 子宫内膜 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系,MSH6缺失 |
| DLD-1 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系,MSH6突变 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3261dupC (p.Phe1088LeufsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3984_3987dupGTCA (p.Glu1330ValfsTer12) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2633T>C (p.Leu878Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.3438+1G>A | 剪接突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致MSH6蛋白功能丧失或显著降低,破坏DNA错配修复,引起基因组不稳定。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明MSH6存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能干扰MutSα复合物的形成或功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003684 (damaged DNA binding) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0006298 (mismatch repair) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• Mismatch repair (MMR) pathway (KEGG: hsa03430)
• Colorectal cancer pathway (KEGG: hsa05210)
蛋白质功能简介
MSH6蛋白是DNA错配修复系统的核心成分,与MSH2形成MutSα异二聚体,识别DNA复制错误并启动修复。该蛋白包含ATPase结构域和DNA结合结构域,通过ATP结合和水解驱动修复过程。MSH6功能缺陷导致突变积累和微卫星不稳定,是多种癌症的驱动因素。
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