NAGA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NAGA基因编码α-N-乙酰半乳糖胺酶,其缺陷导致Kanzaki病,是溶酶体贮积症研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 NAGA
基因全名 alpha-N-acetylgalactosaminidase
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q13.2
NCBI Gene ID 4668 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4668
Ensembl ID ENSG00000100320
UniProt ID P17050
OMIM ID 104170
HGNC ID 7630
基因别名 D22S674, NAGA-1, GALNACase

基因功能与研究简介

NAGA基因编码α-N-乙酰半乳糖胺酶,该酶是溶酶体中的一种外切糖苷酶,参与糖蛋白和糖脂中末端α-N-乙酰半乳糖胺残基的水解。该酶的缺陷会导致溶酶体贮积症,如Kanzaki病和Schindler病。NAGA基因突变可导致酶活性丧失,引起底物在溶酶体中累积,进而引发多系统疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Kanzaki病 NAGA基因突变导致α-N-乙酰半乳糖胺酶活性缺失,底物在溶酶体累积,引起血管角质瘤、神经病变等。 已明确致病
Schindler病 NAGA基因突变导致酶活性降低,表现为轻度神经症状或无症状,属于同一疾病谱。 已明确致病
其他溶酶体贮积症 NAGA基因变异可能与其他溶酶体贮积症相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.973C>T (p.Arg325Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,酶活性丧失
c.985C>T (p.Arg329Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,酶活性丧失
c.1114C>T (p.Arg372Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,酶活性丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):NAGA基因突变导致酶活性降低或丧失,无法正常水解底物,引起溶酶体贮积。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前未发现NAGA基因的功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前未发现NAGA基因的显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004553 (hydrolase activity • hydrolyzing O-glycosyl compounds)
• GO:0005764 (lysosome) • GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)

相关通路

Lysosome (hsa04142)
Glycosaminoglycan degradation (hsa00531)
Other glycan degradation (hsa00511)

蛋白质功能简介

NAGA编码的α-N-乙酰半乳糖胺酶是一种溶酶体酶,属于糖苷水解酶家族。该酶以同源二聚体形式存在,需要锌离子作为辅因子。其底物包括糖蛋白和糖脂中的末端α-N-乙酰半乳糖胺残基。酶活性缺失导致底物累积,引发溶酶体贮积症。

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