NDN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NDN(Necdin)是MAGE家族蛋白,在神经发育和细胞周期调控中发挥关键作用,与普拉德-威利综合征(PWS)相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NDN |
|---|---|
| 基因全名 | necdin, MAGE family member |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q11.2 |
| NCBI Gene ID | 4692 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4692 |
| Ensembl ID | ENSG00000182636 |
| UniProt ID | Q99608 |
| OMIM ID | 602117 |
| HGNC ID | 7673 |
| 基因别名 | MAGE family member NDN, necdin, D15F37S1 |
基因功能与研究简介
NDN基因编码Necdin蛋白,属于MAGE(黑色素瘤抗原)家族。Necdin主要在神经元和骨骼肌中表达,参与细胞周期调控、神经分化、凋亡抑制等过程。NDN基因位于染色体15q11.2区域,该区域与普拉德-威利综合征(PWS)相关。NDN的父源等位基因在脑中表达,母源等位基因因印记而沉默。NDN功能缺失或表达异常与PWS的神经表型有关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 普拉德-威利综合征(Prader-Willi syndrome, PWS) | NDN基因位于PWS关键区域,父源等位基因缺失或印记异常导致NDN表达缺失,可能参与PWS的神经发育异常和认知障碍。 | 已明确致病(PWS相关) |
| 神经发育障碍 | NDN在神经元分化中起重要作用,其表达异常可能影响神经发育,但具体关联证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据文献) |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 中等表达(根据文献) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,内源性表达NDN |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系,低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 缺失(父源等位基因) | 拷贝数变异 | PWS中常见 | Loss of Function(功能缺失) |
| 印记异常 | 表观遗传 | PWS中常见 | Loss of Function(功能缺失) |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
NDN功能缺失(Loss of Function)导致Necdin蛋白表达减少或缺失,影响细胞周期调控和神经分化,与PWS的神经表型相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明NDN存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明NDN存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515(protein binding) | • GO:0005634(nucleus) |
| • GO:0005737(cytoplasm) | • GO:0007049(cell cycle) |
| • GO:0007399(nervous system development) | • GO:0043066(negative regulation of apoptotic process) |
相关通路
• hsa04110(Cell cycle)
• hsa05034(Alcoholism)
• hsa05200(Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
Necdin蛋白属于MAGE家族,主要定位于细胞核和细胞质。它在神经分化中作为生长抑制因子,通过结合p53等蛋白抑制细胞增殖,促进神经元成熟。Necdin还参与细胞凋亡的负调控,保护神经元免受应激损伤。在PWS中,NDN表达缺失可能导致神经发育异常。
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