NECTIN1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NECTIN1基因编码一种细胞粘附分子,参与细胞间连接和病毒入侵,其突变与唇裂/腭裂等发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NECTIN1 |
|---|---|
| 基因全名 | nectin cell adhesion molecule 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q23.3 |
| NCBI Gene ID | 5818 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5818 |
| Ensembl ID | ENSG00000144802 |
| UniProt ID | Q15223 |
| OMIM ID | 600644 |
| HGNC ID | 17664 |
| 基因别名 | PRR1, PVRL1, CD111, CLPED1, ED4, HIgR, HVEC, PVRR1, SK-12 |
基因功能与研究简介
NECTIN1基因编码nectin-1蛋白,属于nectin家族,是一种I型跨膜糖蛋白,参与细胞间粘附、细胞极性、细胞迁移和免疫调节。NECTIN1在多种组织中表达,尤其在皮肤、黏膜和神经系统中高表达。NECTIN1作为多种病毒(如单纯疱疹病毒HSV-1和HSV-2)的受体,介导病毒入侵。NECTIN1的突变与唇裂/腭裂-外胚层发育不良综合征(CLPED1)和单纯疱疹病毒性脑炎(HSE)等疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 唇裂/腭裂-外胚层发育不良综合征(CLPED1) | NECTIN1基因突变导致nectin-1蛋白功能缺失,影响细胞间粘附,导致胚胎发育中面部融合异常,表现为唇裂/腭裂、外胚层发育不良等。 | 已明确致病 |
| 单纯疱疹病毒性脑炎(HSE) | NECTIN1作为HSV-1/2的受体,其突变可能影响病毒进入神经细胞,增加HSE易感性。 | 具有较强研究证据 |
| 非综合征性唇裂/腭裂 | NECTIN1基因的某些变异可能增加非综合征性唇裂/腭裂的风险。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 口腔黏膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.400C>T (p.Arg134Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.755T>C (p.Leu252Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白折叠和功能 |
| c.1115G>A (p.Arg372His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响病毒结合 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致nectin-1蛋白表达减少或功能丧失,影响细胞粘附,与CLPED1相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005912 (adherens junction) |
| • GO:0001618 (virus receptor activity) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human)
• Herpes simplex infection - Homo sapiens (human)
蛋白质功能简介
NECTIN1蛋白(nectin-1)是一种I型跨膜糖蛋白,属于nectin家族。其胞外区包含三个免疫球蛋白样结构域,介导同源和异源二聚化,参与细胞间粘附。胞内区与afadin等蛋白相互作用,连接细胞骨架。NECTIN1在多种组织中表达,尤其在皮肤和黏膜中高表达,作为HSV-1/2的受体,介导病毒进入细胞。NECTIN1的突变可导致细胞粘附功能受损,与唇裂/腭裂等发育异常相关。