NELFB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NELFB是负延伸因子复合物的核心亚基,调控RNA聚合酶II的转录延伸,与多种癌症和发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 NELFB
基因全名 negative elongation factor complex member B
基因类型 protein-coding
染色体位置 9q34.3
NCBI Gene ID 25920 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25920
Ensembl ID ENSG00000107104
UniProt ID Q8WX92
OMIM ID 615545
HGNC ID 28683
基因别名 COBRA1, NELF-B, NELF B

基因功能与研究简介

NELFB(negative elongation factor complex member B)是负延伸因子(NELF)复合物的一个亚基,该复合物通过结合RNA聚合酶II(Pol II)来暂停转录延伸。NELFB在调控基因表达、细胞分化和发育中发挥关键作用。研究表明,NELFB参与DNA损伤应答、细胞周期调控和凋亡等过程,其异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 NELFB在乳腺癌中表达上调,可能通过调控雌激素受体靶基因促进肿瘤进展。 较强研究证据
肺癌 NELFB在肺癌组织中高表达,与不良预后相关,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 较强研究证据
神经发育障碍 NELFB基因突变与智力障碍和发育迟缓相关,可能影响神经元基因表达。 已明确致病
前列腺癌 NELFB在前列腺癌中表达异常,可能通过雄激素受体信号通路影响肿瘤进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响NELF复合物功能
c.567_568insA (p.Gln190ThrfsTer5) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响转录调控
c.890A>G (p.Glu297Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白截短,使NELF复合物功能受损,影响转录延伸调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明NELFB存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明NELFB突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006351 transcription • DNA-templated
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006366 transcription by RNA polymerase II • GO:0034243 regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
• GO:0005634 nucleus • GO:0005654 nucleoplasm
• GO:0032044 NELF complex

相关通路

hsa03040 Spliceosome
hsa04110 Cell cycle
hsa05200 Pathways in cancer

蛋白质功能简介

NELFB蛋白是负延伸因子(NELF)复合物的B亚基,该复合物由NELFA、NELFB、NELFC、NELFD和NELFE五个亚基组成。NELF复合物通过结合RNA聚合酶II的暂停位点,抑制转录延伸,从而调控基因表达。NELFB蛋白包含一个保守的NELF-B结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。NELFB在细胞核中表达,参与DNA损伤应答、细胞周期调控和凋亡等过程。

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