NELFCD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NELFCD是负延伸因子复合物的关键亚基,调控RNA聚合酶II的转录延伸,参与细胞分化和免疫应答,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NELFCD |
|---|---|
| 基因全名 | Negative Elongation Factor Complex Member C/D |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q13.33 |
| NCBI Gene ID | 51497 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51497 |
| Ensembl ID | ENSG00000101115 |
| UniProt ID | Q8IXH7 |
| OMIM ID | 605298 |
| HGNC ID | 15962 |
| 基因别名 | TH1L, NELF-C, NELF-D |
基因功能与研究简介
NELFCD基因编码负延伸因子(NELF)复合物的C/D亚基,该复合物通过结合RNA聚合酶II并诱导启动子近端暂停来负调控转录延伸。NELFCD在细胞分化、免疫应答和应激反应中发挥重要作用。其功能异常与多种疾病相关,包括癌症和发育障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | NELFCD表达异常可能影响转录调控,促进肿瘤发生发展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | NELFCD在肝癌中高表达,可能通过调控细胞增殖相关基因表达促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 神经发育障碍 | NELFCD突变可能影响神经前体细胞的分化,导致发育异常。 | 潜在关联 |
| 免疫缺陷 | NELFCD参与T细胞发育和功能,其异常可能导致免疫缺陷。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789_790insA | 移码突变 | 罕见 | 导致移码,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变、移码突变等导致蛋白功能丧失,可能影响NELF复合物的组装和功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006351 - transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006355 - regulation of transcription | • DNA-templated |
| • GO:0006366 - transcription by RNA polymerase II | • GO:0010628 - positive regulation of gene expression |
| • GO:0005634 - nucleus |
相关通路
• hsa03022 - Basal transcription factors
• hsa04010 - MAPK signaling pathway
• hsa04150 - mTOR signaling pathway
蛋白质功能简介
NELFCD蛋白是负延伸因子(NELF)复合物的亚基,与NELF-A、NELF-B和NELF-E共同组成复合物。该复合物通过结合RNA聚合酶II的暂停位点,抑制转录延伸。NELFCD在细胞核中表达,参与调控基因表达,影响细胞增殖、分化和凋亡。其功能异常与多种疾病相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|