NID2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NID2编码nidogen-2,是基底膜的重要组分,参与细胞黏附、迁移和肿瘤抑制,与多种癌症及遗传性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 NID2
基因全名 nidogen 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q22.1
NCBI Gene ID 22795 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22795
Ensembl ID ENSG00000100823
UniProt ID Q14112
OMIM ID 605399
HGNC ID 13389
基因别名 NID-2, nidogen-2, osteonidogen

基因功能与研究简介

NID2基因编码nidogen-2,一种基底膜(basement membrane)的糖蛋白。nidogen-2与层粘连蛋白(laminin)、IV型胶原蛋白(collagen IV)等相互作用,参与基底膜的结构组装和细胞黏附。NID2在多种组织中表达,尤其在血管和上皮组织中丰富。研究表明NID2在肿瘤中常因启动子甲基化而表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,NID2突变与一些遗传性疾病相关,如先天性肾病综合征(Finnish type)和肌张力障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
先天性肾病综合征(Finnish type) NID2突变导致基底膜结构异常,影响肾小球滤过屏障,导致蛋白尿和肾病综合征。 OMIM
肌张力障碍 NID2突变可能影响基底膜在神经肌肉接头的功能,导致运动障碍。 OMIM
多种癌症(如膀胱癌、肺癌、乳腺癌) NID2启动子甲基化导致表达沉默,可能促进肿瘤侵袭和转移。 COSMIC, ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 内皮细胞
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.497G>A (p.Arg166His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.1123C>T (p.Arg375Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
启动子甲基化 表观遗传改变 常见于肿瘤 导致基因表达沉默
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变、移码突变等导致蛋白功能丧失,与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005604 (basement membrane) • GO:0031012 (extracellular matrix)

相关通路

ECM-receptor interaction (hsa04512)
Focal adhesion (hsa04510)
PI3K-Akt signaling pathway (hsa04151)

蛋白质功能简介

nidogen-2是一种分泌性糖蛋白,属于nidogen家族。它包含三个结构域:N端结构域、中央结构域和C端结构域。nidogen-2通过其G2结构域与层粘连蛋白结合,通过G3结构域与IV型胶原蛋白结合,从而连接基底膜中的主要成分。nidogen-2还参与细胞黏附、迁移和信号转导。在肿瘤中,NID2表达下调或缺失,可能通过影响基底膜完整性促进肿瘤侵袭。

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