NLE1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NLE1是Notch信号通路的关键调控因子,参与蛋白质质量控制,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 NLE1
基因全名 notchless homolog 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q12
NCBI Gene ID 54475 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54475
Ensembl ID ENSG00000173598
UniProt ID Q96MS0
OMIM ID 617907
HGNC ID 24898
基因别名 NOTCHLESS, FLJ10829

基因功能与研究简介

NLE1(notchless homolog 1)基因编码一个含有WD40重复结构域的蛋白质,该蛋白是Notch信号通路的负调控因子,参与调控细胞分化、增殖和凋亡。NLE1还参与核糖体生物发生和蛋白质质量控制。研究表明,NLE1功能缺失与神经发育障碍相关,包括小头畸形和智力障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 NLE1突变导致功能缺失,影响Notch信号通路和核糖体功能,导致神经发育异常。 已明确致病
小头畸形 NLE1突变与常染色体隐性遗传小头畸形相关。 已明确致病
智力障碍 NLE1突变导致智力障碍,常伴随小头畸形。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.890A>G (p.Tyr297Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白质功能丧失或显著降低,如无义突变、移码突变等。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):突变导致蛋白质获得新的或增强的功能,目前NLE1未见此类突变报道。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰正常蛋白的功能,目前NLE1未见此类突变报道。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0007221 positive regulation of Notch signaling pathway
• GO:0006364 rRNA processing

相关通路

Notch signaling pathway (WP268)
Ribosome biogenesis (WP123)

蛋白质功能简介

NLE1蛋白含有WD40重复结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用。它作为Notch信号通路的负调控因子,通过促进Notch受体的降解来抑制信号传导。此外,NLE1还参与核糖体RNA加工和核糖体组装,对细胞生长和增殖至关重要。

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