NLRC3基因|基因功能、疾病关联、突变与免疫调控研究

NLRC3是NOD样受体家族中的一员,作为炎症和免疫反应的负调控因子,在多种疾病中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 NLRC3
基因全名 NLR family CARD domain containing 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 16p13.3
NCBI Gene ID 197358 ncbi.nlm.nih.gov/gene/197358
Ensembl ID ENSG00000174197
UniProt ID Q7Z434
OMIM ID 611547
HGNC ID 29889
基因别名 CLR16.2, NOD3, FLJ40298

基因功能与研究简介

NLRC3(NLR family CARD domain containing 3)是NOD样受体(NLR)家族的一员,主要作为炎症和免疫反应的负调控因子。它通过抑制NF-κB和I型干扰素信号通路,调节先天免疫应答。NLRC3在多种免疫细胞中表达,参与调控炎症反应、细胞自噬和肿瘤发生等过程。研究表明,NLRC3的异常表达与多种疾病相关,包括炎症性疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
炎症性肠病 NLRC3表达下调可能减弱其对NF-κB的抑制,导致肠道炎症加剧 具有较强研究证据
结直肠癌 NLRC3在结直肠癌中表达降低,可能通过促进肿瘤炎症微环境而促进肿瘤进展 具有较强研究证据
脓毒症 NLRC3负调控炎症反应,其表达降低可能加重脓毒症相关的炎症损伤 潜在关联
自身免疫性疾病 NLRC3可能通过调节免疫耐受影响自身免疫疾病的发生 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs34536443 SNV 0.1% 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.1000C>T SNV 暂无可靠数据 可能导致氨基酸改变,功能影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致NLRC3抑制炎症的能力下降,从而增强炎症反应。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前尚无明确证据表明NLRC3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前尚无明确证据表明NLRC3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005829 cytosol • GO:0007165 signal transduction
• GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0045087 innate immune response
• GO:0032088 negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity

相关通路

NOD-like receptor signaling pathway (hsa04621)
Cytosolic DNA-sensing pathway (hsa04623)
RIG-I-like receptor signaling pathway (hsa04622)

蛋白质功能简介

NLRC3蛋白属于NOD样受体家族,包含N端CARD结构域、中央NACHT结构域和C端LRR重复序列。它主要定位于细胞质,通过其CARD结构域与下游信号分子相互作用,抑制NF-κB和I型干扰素信号通路。NLRC3在调节炎症反应、细胞自噬和抗肿瘤免疫中发挥重要作用。

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