NLRC4基因|基因功能、疾病关联、突变与炎症小体研究

NLRC4是炎症小体关键传感器,调控先天免疫,其突变可导致自身炎症性疾病和巨噬细胞活化综合征。

基因信息卡

基因符号 NLRC4
基因全名 NLR family CARD domain containing 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p22.3
NCBI Gene ID 58484 ncbi.nlm.nih.gov/gene/58484
Ensembl ID ENSG00000091136
UniProt ID Q9NPP4
OMIM ID 606831
HGNC ID 16412
基因别名 CLR2.1, CARD12, CLAN, IPAF

基因功能与研究简介

NLRC4基因编码NOD样受体家族成员,是一种胞质内模式识别受体,主要参与细菌鞭毛蛋白和III型分泌系统(T3SS)的识别。NLRC4与NAIP蛋白结合形成炎症小体复合物,激活caspase-1,促进IL-1β和IL-18的成熟和分泌,并诱导焦亡。NLRC4在先天免疫中发挥关键作用,其功能异常与多种自身炎症性疾病和感染易感性相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
巨噬细胞活化综合征 NLRC4功能获得性突变导致炎症小体过度激活,IL-18和IL-1β过度产生,引发全身性炎症。 已明确致病
自身炎症综合征(NLRC4相关) NLRC4功能获得性突变导致反复发热、皮疹、关节炎等炎症表现。 已明确致病
婴儿期肠炎 NLRC4突变可导致早发性炎症性肠病,表现为严重肠道炎症。 已明确致病
军团菌感染易感性 NLRC4参与军团菌的识别,其缺陷可能增加感染风险。 具有较强研究证据
沙门氏菌感染易感性 NLRC4对沙门氏菌的免疫应答至关重要,突变可能影响宿主防御。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血白细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
U937 暂无可靠数据 单核细胞系
HL-60 暂无可靠数据 早幼粒细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞系
HeLa 暂无可靠数据 上皮细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
p.Val341Ala 错义突变 罕见 功能获得性,增强炎症小体活性
p.Thr337Ser 错义突变 罕见 功能获得性,导致自身炎症
p.His443Pro 错义突变 罕见 功能获得性,与巨噬细胞活化综合征相关
p.Arg105Cys 错义突变 罕见 功能获得性,与婴儿期肠炎相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变导致NLRC4蛋白功能丧失,可能削弱免疫应答,但临床报道较少。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变导致NLRC4炎症小体过度激活,是自身炎症性疾病的主要机制。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常NLRC4功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005829 cytosol • GO:0042802 identical protein binding
• GO:0002218 activation of innate immune response • GO:0006954 inflammatory response
• GO:0072559 NLRP3 inflammasome complex • GO:0032729 positive regulation of type II interferon production
• GO:0001819 positive regulation of cytokine production • GO:0006915 apoptotic process

相关通路

NOD-like receptor signaling pathway (hsa04621)
Cytosolic DNA-sensing pathway (hsa04623)
Salmonella infection (hsa05132)
Legionellosis (hsa05134)

蛋白质功能简介

NLRC4蛋白属于NOD样受体家族,包含N端CARD结构域、中央NACHT结构域和C端LRR结构域。在静息状态下,NLRC4自抑制;当识别配体(如鞭毛蛋白)时,与NAIP蛋白结合,发生寡聚化,招募ASC和caspase-1,形成炎症小体复合物。该复合物促进pro-IL-1β和pro-IL-18的切割成熟,并诱导焦亡。NLRC4在巨噬细胞、单核细胞和肠道上皮细胞中表达,对细菌感染免疫至关重要。

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