NLRP3基因|基因功能、疾病关联、突变与炎症小体研究
NLRP3是炎症反应的关键调控因子,其突变与多种自身炎症性疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NLRP3 |
|---|---|
| 基因全名 | NLR family pyrin domain containing 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q44 |
| NCBI Gene ID | 114548 ncbi.nlm.nih.gov/gene/114548 |
| Ensembl ID | ENSG00000162711 |
| UniProt ID | Q96P20 |
| OMIM ID | 606416 |
| HGNC ID | 16400 |
| 基因别名 | CIAS1, CLR1.1, FCAS, MWS, NALP3, PYPAF1 |
基因功能与研究简介
NLRP3基因编码NOD样受体家族含pyrin结构域蛋白3,是炎症小体复合物的核心组分。NLRP3炎症小体在固有免疫中发挥关键作用,能够响应多种病原体和危险信号,激活caspase-1,促进IL-1β和IL-18的成熟和分泌,从而介导炎症反应。NLRP3功能异常与多种自身炎症性疾病、代谢性疾病和神经退行性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Cryopyrin相关周期性综合征(CAPS) | NLRP3功能获得性突变导致炎症小体过度激活,IL-1β过度产生,引起全身性炎症。 | 已明确致病 |
| 家族性寒冷性自身炎症综合征(FCAS) | NLRP3突变导致对寒冷刺激的异常炎症反应。 | 已明确致病 |
| Muckle-Wells综合征(MWS) | NLRP3突变导致慢性炎症、听力损失和淀粉样变性。 | 已明确致病 |
| 新生儿多系统炎症性疾病(NOMID) | NLRP3突变导致严重的新生儿期起病的多系统炎症。 | 已明确致病 |
| 痛风 | NLRP3炎症小体被尿酸盐晶体激活,参与痛风炎症发作。 | 较强研究证据 |
| 2型糖尿病 | NLRP3炎症小体参与胰岛炎症和胰岛素抵抗。 | 较强研究证据 |
| 阿尔茨海默病 | NLRP3炎症小体在神经炎症中发挥作用,与Aβ沉积相关。 | 潜在关联 |
| 癌症 | NLRP3在肿瘤微环境中调节炎症,可能促进或抑制肿瘤发生,具体作用取决于肿瘤类型。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系,常用于NLRP3炎症小体研究 |
| U937 | 暂无可靠数据 | 单核细胞系 |
| RAW264.7 | 暂无可靠数据 | 小鼠巨噬细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| p.Asp303Asn (D303N) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性,导致炎症小体过度激活 |
| p.Arg260Trp (R260W) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性,与CAPS相关 |
| p.Gln703Lys (Q703K) | 错义突变 | 常见多态性 | 可能增加炎症小体活性,与疾病风险相关 |
| p.Val198Met (V198M) | 错义突变 | 罕见 | 功能获得性,与FCAS相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
NLRP3功能缺失突变较少见,可能导致免疫缺陷或对感染易感性增加,但具体证据有限。
Gain of Function(功能获得,GOF)
NLRP3功能获得性突变是CAPS等自身炎症性疾病的主要致病机制,导致炎症小体过度激活。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
NLRP3显性负性突变可能干扰正常炎症小体组装,但证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0002218 (activation of innate immune response) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0006954 (inflammatory response) | • GO:0010008 (endosome membrane) |
| • GO:0032991 (protein-containing complex) | • GO:0043123 (positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling) |
| • GO:0045087 (innate immune response) | • GO:0061702 (inflammasome complex) |
相关通路
• NOD-like receptor signaling pathway (KEGG: hsa04621)
• Cytosolic DNA-sensing pathway (KEGG: hsa04623)
• IL-17 signaling pathway (KEGG: hsa04657)
• Salmonella infection (KEGG: hsa05132)
• Tuberculosis (KEGG: hsa05152)
• Influenza A (KEGG: hsa05164)
• Pertussis (KEGG: hsa05133)
• Legionellosis (KEGG: hsa05134)
• Toll-like receptor signaling pathway (KEGG: hsa04620)
• C-type lectin receptor signaling pathway (KEGG: hsa04625)
蛋白质功能简介
NLRP3蛋白包含三个结构域:N端PYD结构域、中央NACHT结构域和C端LRR结构域。PYD结构域介导与ASC的相互作用,NACHT结构域具有ATPase活性,参与蛋白寡聚化,LRR结构域可能参与配体识别和自身调节。NLRP3在巨噬细胞、单核细胞等免疫细胞中高表达,在炎症信号刺激下组装成炎症小体复合物,激活caspase-1,进而切割pro-IL-1β和pro-IL-18,产生成熟细胞因子,并诱导细胞焦亡。
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