NOD1基因|基因功能、疾病关联、突变与免疫研究

NOD1是固有免疫系统中的关键模式识别受体,参与细菌肽聚糖的识别和炎症反应调控。

基因信息卡

基因符号 NOD1
基因全名 nucleotide binding oligomerization domain containing 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 7p14.3
NCBI Gene ID 10392 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10392
Ensembl ID ENSG00000106100
UniProt ID Q9Y239
OMIM ID 605980
HGNC ID 7869
基因别名 CARD4, NLRC1

基因功能与研究简介

NOD1(核苷酸结合寡聚化结构域蛋白1)是NOD样受体家族的重要成员,主要作为胞内模式识别受体,识别细菌肽聚糖的特定结构(尤其是γ-D-谷氨酰-二氨基庚二酸,iE-DAP),进而激活NF-κB和MAPK信号通路,诱导炎症因子和抗菌因子的表达。NOD1在固有免疫中发挥关键作用,参与宿主防御、炎症调控和细胞自噬等过程。其基因多态性与多种炎症性疾病和感染易感性相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
炎症性肠病 NOD1基因多态性可能影响蛋白表达或功能,导致肠道免疫耐受失衡,增加炎症性肠病风险。 较强研究证据
哮喘 NOD1变异与哮喘易感性相关,可能通过影响气道炎症反应参与疾病发生。 较强研究证据
幽门螺杆菌感染相关胃炎 NOD1识别幽门螺杆菌肽聚糖,其变异可能影响感染后的炎症反应和疾病结局。 较强研究证据
结节病 NOD1基因多态性与结节病易感性相关,可能参与肉芽肿形成。 潜在关联
癌症 NOD1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调节炎症微环境影响肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周血白细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
THP-1 暂无可靠数据 单核细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
Caco-2 暂无可靠数据 结肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs6958571 SNP 未知 可能影响NOD1表达或功能,与炎症性肠病相关
rs2075820 SNP 未知 可能影响NOD1功能,与哮喘相关
rs2907749 SNP 未知 可能影响NOD1表达,与幽门螺杆菌感染相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致NOD1蛋白表达降低或功能丧失,削弱对细菌肽聚糖的识别和免疫应答,可能增加感染风险。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强NOD1信号传导,导致过度炎症反应,可能参与自身炎症性疾病。目前尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰野生型NOD1功能,抑制信号通路,可能影响免疫应答。目前尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005524 ATP binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005829 cytosol
• GO:0007165 signal transduction • GO:0007249 I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• GO:0009617 response to bacterium • GO:0032496 response to lipopolysaccharide
• GO:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0051092 positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity

相关通路

NOD-like receptor signaling pathway (hsa04621)
Cytosolic DNA-sensing pathway (hsa04623)
Inflammatory bowel disease (hsa05321)

蛋白质功能简介

NOD1蛋白由953个氨基酸组成,包含N端CARD结构域、中央NACHT结构域和C端LRR结构域。CARD结构域介导与下游激酶RIPK2的相互作用,NACHT结构域具有ATPase活性,参与蛋白寡聚化,LRR结构域负责配体识别。NOD1通过识别细菌肽聚糖片段iE-DAP,激活NF-κB和MAPK信号通路,诱导促炎细胞因子和抗菌肽表达。此外,NOD1还参与自噬、细胞凋亡和适应性免疫的调控。

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