NOLC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NOLC1是核仁磷酸蛋白,参与核糖体生物发生和细胞周期调控,与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 NOLC1
基因全名 nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q24.32
NCBI Gene ID 9221 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9221
Ensembl ID ENSG00000166197
UniProt ID Q14978
OMIM ID 602891
HGNC ID 7867
基因别名 NOPP140; NS5ATP13; P130; NAP; NOPP140

基因功能与研究简介

NOLC1(核仁和卷曲体磷酸蛋白1)是一种主要在核仁和卷曲体中表达的磷酸化蛋白。它参与核糖体RNA的加工和核糖体生物发生,并在细胞周期调控、DNA损伤应答和基因转录调控中发挥作用。NOLC1通过与多种蛋白质相互作用,如RNA聚合酶I和上游结合因子(UBF),调节rRNA基因的转录。此外,NOLC1在细胞应激条件下可发生磷酸化修饰,影响其亚细胞定位和功能。研究表明,NOLC1在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 NOLC1在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 较强研究证据
结直肠癌 NOLC1在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和预后相关。 较强研究证据
乳腺癌 NOLC1在乳腺癌中表达异常,可能影响细胞周期和增殖。 潜在关联
肺癌 NOLC1在非小细胞肺癌中高表达,可能作为预后标志物。 潜在关联
胃癌 NOLC1在胃癌中表达上调,与肿瘤侵袭和转移相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MGC803 暂无可靠数据 胃癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Trp) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.1567G>A (p.Val523Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白稳定性
c.789del (p.Gln264fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致NOLC1蛋白功能丧失或减弱,可能影响核糖体生物发生和细胞增殖。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:增强NOLC1的促增殖或抗凋亡功能,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰野生型NOLC1的功能,可能影响核仁结构和功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0005634 nucleus
• GO:0003723 RNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0006364 rRNA processing • GO:0042254 ribosome biogenesis
• GO:0051726 regulation of cell cycle

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

NOLC1蛋白是一种核仁磷酸蛋白,含有多个磷酸化位点,其磷酸化状态受细胞周期和应激信号调控。NOLC1在核仁中与RNA聚合酶I复合物相互作用,促进rRNA基因的转录和加工。此外,NOLC1还参与卷曲体的形成和功能,可能在mRNA剪接和加工中发挥作用。NOLC1的异常表达与多种肿瘤相关,可能通过影响核糖体生物发生和细胞周期进程促进肿瘤发生。

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