NOLC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NOLC1是核仁磷酸蛋白,参与核糖体生物发生和细胞周期调控,与多种癌症及发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NOLC1 |
|---|---|
| 基因全名 | nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q24.32 |
| NCBI Gene ID | 9221 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9221 |
| Ensembl ID | ENSG00000166197 |
| UniProt ID | Q14978 |
| OMIM ID | 602891 |
| HGNC ID | 7867 |
| 基因别名 | NOPP140; NS5ATP13; P130; NAP; NOPP140 |
基因功能与研究简介
NOLC1(核仁和卷曲体磷酸蛋白1)是一种主要在核仁和卷曲体中表达的磷酸化蛋白。它参与核糖体RNA的加工和核糖体生物发生,并在细胞周期调控、DNA损伤应答和基因转录调控中发挥作用。NOLC1通过与多种蛋白质相互作用,如RNA聚合酶I和上游结合因子(UBF),调节rRNA基因的转录。此外,NOLC1在细胞应激条件下可发生磷酸化修饰,影响其亚细胞定位和功能。研究表明,NOLC1在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | NOLC1在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | NOLC1在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | NOLC1在乳腺癌中表达异常,可能影响细胞周期和增殖。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | NOLC1在非小细胞肺癌中高表达,可能作为预后标志物。 | 潜在关联 |
| 胃癌 | NOLC1在胃癌中表达上调,与肿瘤侵袭和转移相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MGC803 | 暂无可靠数据 | 胃癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1567G>A (p.Val523Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.789del (p.Gln264fs) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致NOLC1蛋白功能丧失或减弱,可能影响核糖体生物发生和细胞增殖。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强NOLC1的促增殖或抗凋亡功能,可能促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰野生型NOLC1的功能,可能影响核仁结构和功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005730 nucleolus | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0006364 rRNA processing | • GO:0042254 ribosome biogenesis |
| • GO:0051726 regulation of cell cycle |
相关通路
• Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
• rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
NOLC1蛋白是一种核仁磷酸蛋白,含有多个磷酸化位点,其磷酸化状态受细胞周期和应激信号调控。NOLC1在核仁中与RNA聚合酶I复合物相互作用,促进rRNA基因的转录和加工。此外,NOLC1还参与卷曲体的形成和功能,可能在mRNA剪接和加工中发挥作用。NOLC1的异常表达与多种肿瘤相关,可能通过影响核糖体生物发生和细胞周期进程促进肿瘤发生。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|