NOP58基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NOP58是核糖体生物发生和pre-rRNA加工的关键因子,其功能异常与核糖体病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 NOP58
基因全名 NOP58 ribonucleoprotein
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q33.1
NCBI Gene ID 51602 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51602
Ensembl ID ENSG00000115524
UniProt ID Q9Y2X3
OMIM ID 606469
HGNC ID 13717
基因别名 NOP5, NOP5A, HSPC120

基因功能与研究简介

NOP58(NOP58 ribonucleoprotein)是核仁蛋白,参与核糖体生物发生,是C/D box snoRNP复合物的核心组分,负责pre-rRNA的2'-O-甲基化修饰。NOP58通过与NOP56、FBL和SNU13等蛋白相互作用,在核糖体RNA加工和核糖体亚基组装中发挥关键作用。NOP58功能异常可能导致核糖体生物发生障碍,进而影响细胞增殖和分化,与某些遗传病和肿瘤的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
核糖体病(Ribosomopathy) NOP58突变可能导致核糖体生物发生异常,影响蛋白质合成,与核糖体病的发生相关。 暂无明确证据
癌症(Cancer) NOP58在多种肿瘤中表达上调,可能通过促进核糖体生物发生支持肿瘤细胞增殖。 具有较强研究证据
发育异常(Developmental disorders) NOP58功能缺失可能影响胚胎发育,但具体关联尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 核仁定位
HEK293 暂无可靠数据 核仁定位
K562 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.456C>T (p.Pro152Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白相互作用
c.789del (p.Glu264fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变或无义突变,导致NOP58蛋白功能缺失,影响核糖体生物发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明NOP58存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

目前暂无明确证据表明NOP58存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0003723 RNA binding
• GO:0006364 rRNA processing • GO:0030515 snoRNA binding
• GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA • 5.8S rRNA
• LSU-rRNA)

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

NOP58蛋白是C/D box snoRNP复合物的核心组分,与NOP56、FBL和SNU13形成复合物,催化pre-rRNA的2'-O-甲基化。该蛋白定位于核仁,参与核糖体RNA加工和核糖体亚基组装。NOP58的N端区域负责与NOP56相互作用,C端区域参与RNA结合。NOP58在细胞增殖中起重要作用,其表达水平与细胞生长速率相关。

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