NOTUM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NOTUM编码一种棕榈油酰蛋白羧酸酯酶,通过去棕榈油酰化Wnt蛋白负调控Wnt信号通路,在发育、干细胞维持及多种疾病中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | NOTUM |
|---|---|
| 基因全名 | notum, palmitoleoyl-protein carboxylesterase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q25.3 |
| NCBI Gene ID | 147111 ncbi.nlm.nih.gov/gene/147111 |
| Ensembl ID | ENSG00000185269 |
| UniProt ID | Q6P988 |
| OMIM ID | 611963 |
| HGNC ID | 27106 |
| 基因别名 | NOTUM2, FLJ12770 |
基因功能与研究简介
NOTUM基因编码一种分泌型棕榈油酰蛋白羧酸酯酶,属于α/β水解酶家族。该酶通过去除Wnt蛋白上的棕榈油酰基团,从而负调控Wnt信号通路。NOTUM在胚胎发育、成体干细胞维持、组织稳态中发挥重要作用,其异常表达与多种疾病(如癌症、骨骼发育异常)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 家族性腺瘤性息肉病 | NOTUM表达上调可能通过抑制Wnt信号通路影响肠道干细胞,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 肝细胞癌 | NOTUM在肝癌中高表达,可能通过调控Wnt通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | NOTUM表达异常与结直肠癌的发生发展相关,可能作为潜在治疗靶点。 | 较强研究证据 |
| 骨关节炎 | NOTUM在骨关节炎中表达上调,可能参与软骨代谢和炎症反应。 | 潜在关联 |
| 成骨不全 | NOTUM突变可能导致骨骼发育异常,但具体致病性尚需验证。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结直肠腺癌细胞系 |
| SW480 | 暂无可靠数据 | 结直肠腺癌细胞系 |
| MG-63 | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失酶活性,引起功能丧失(Loss of Function) |
| c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致移码和提前终止,功能丧失(Loss of Function) |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白,功能丧失(Loss of Function) |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变、移码突变,导致NOTUM蛋白截短或降解,失去去棕榈油酰化酶活性,从而增强Wnt信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明NOTUM存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明NOTUM存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0016787 (hydrolase activity) |
| • GO:0017091 (palmitoleoyl-protein carboxylesterase activity) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0007275 (multicellular organism development) | • GO:0030178 (negative regulation of Wnt signaling pathway) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (P00057)
• Hippo signaling pathway (P00053)
蛋白质功能简介
NOTUM蛋白是一种分泌型棕榈油酰蛋白羧酸酯酶,属于α/β水解酶家族。它通过去除Wnt蛋白上的棕榈油酰基团,使Wnt蛋白失活,从而负调控Wnt信号通路。NOTUM在胚胎发育、成体干细胞维持、组织稳态中发挥关键作用。其异常表达与多种癌症(如肝癌、结直肠癌)及骨骼发育异常相关。