NPAT基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NPAT基因编码p220蛋白,是组蛋白基因转录的关键调控因子,参与细胞周期调控和DNA损伤应答,与鼻咽癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 NPAT
基因全名 nuclear protein, co-activator of histone transcription
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q22.3
NCBI Gene ID 4863 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4863
Ensembl ID ENSG00000149311
UniProt ID Q14457
OMIM ID 601448
HGNC ID 7896
基因别名 E14, FLJ10895, MGC144578, p220

基因功能与研究简介

NPAT基因编码核蛋白p220,是组蛋白基因转录的关键共激活因子。NPAT通过结合组蛋白基因启动子,促进组蛋白H4和H2B的转录,从而在细胞周期S期调控染色质组装。NPAT还参与DNA损伤应答和细胞周期检查点调控,其功能异常与多种肿瘤发生相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
鼻咽癌 NPAT基因的拷贝数增加和过表达与鼻咽癌的发生发展相关,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡发挥作用。 较强研究证据
淋巴瘤 NPAT基因的突变或表达异常在部分淋巴瘤中被检测到,可能参与肿瘤发生。 潜在关联
其他肿瘤 NPAT在多种肿瘤中表达上调,如乳腺癌、肺癌等,但具体机制尚待阐明。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.456delC (p.Leu153fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

NPAT基因的移码突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响组蛋白转录调控,进而导致细胞周期异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

NPAT基因的过表达或拷贝数增加可能产生功能获得效应,促进细胞增殖,与肿瘤发生相关。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明NPAT突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0006334 nucleosome assembly
• GO:0006974 cellular response to DNA damage stimulus

相关通路

Cell cycle
DNA damage response
Histone modification

蛋白质功能简介

NPAT蛋白(p220)是一种核蛋白,主要定位于细胞核,作为组蛋白基因转录的共激活因子。它通过直接结合组蛋白基因启动子,招募转录复合物,促进组蛋白H4和H2B的表达。NPAT在细胞周期S期被CDK2磷酸化,调控其活性。此外,NPAT参与DNA损伤应答,在DNA损伤时被ATM/ATR磷酸化,参与细胞周期检查点调控。NPAT的异常表达与多种肿瘤相关,是潜在的肿瘤标志物和治疗靶点。

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