NPLOC4基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
NPLOC4是内质网相关蛋白降解(ERAD)途径的关键组分,参与蛋白质质量控制,与神经发育和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NPLOC4 |
|---|---|
| 基因全名 | NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 17q25.3 |
| NCBI Gene ID | 55666 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55666 |
| Ensembl ID | ENSG00000141425 |
| UniProt ID | Q8TAT6 |
| OMIM ID | 610384 |
| HGNC ID | 24925 |
| 基因别名 | NPL4, NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor |
基因功能与研究简介
NPLOC4(NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor)编码的蛋白质是内质网相关蛋白降解(ERAD)途径的关键组分,与VCP/p97和UFD1形成复合物,识别多泛素化底物并参与其提取和降解。该基因在蛋白质质量控制中发挥重要作用,其功能异常与神经发育障碍和肿瘤发生相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | NPLOC4突变可能影响ERAD功能,导致蛋白质稳态失衡,与神经发育异常相关。 | ClinVar有致病性变异报道,但证据有限。 |
| 癌症 | NPLOC4在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响蛋白质降解参与肿瘤发生发展。 | COSMIC数据库有体细胞突变记录,但功能意义尚不明确。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1123C>T (p.Arg375Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失。 |
| c.1567A>G (p.Thr523Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,影响ERAD途径。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process | • GO:0030433 ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005783 endoplasmic reticulum |
相关通路
• Endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway (Reactome: R-HSA-983168)
• VCP/p97-mediated degradation (Reactome: R-HSA-983168)
蛋白质功能简介
NPLOC4蛋白是ERAD途径的关键组分,与VCP/p97和UFD1形成复合物,识别多泛素化底物并促进其从内质网提取和降解。该蛋白在维持蛋白质稳态中发挥重要作用,其功能异常可能导致蛋白质错误折叠和聚集,与神经退行性疾病和肿瘤发生相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|