NPNT基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NPNT(Nephronectin)是一种细胞外基质蛋白,在肾脏发育、整合素信号传导及多种疾病中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 NPNT
基因全名 nephronectin
基因类型 protein coding
染色体位置 4q24
NCBI Gene ID 255743 ncbi.nlm.nih.gov/gene/255743
Ensembl ID ENSG00000168758
UniProt ID Q6UXI9
OMIM ID 610306
HGNC ID 19723
基因别名 POEM, FLJ14490

基因功能与研究简介

NPNT(nephronectin)编码一种细胞外基质蛋白,属于EGF样蛋白家族。该蛋白包含一个RGD基序,可与整合素α8β1结合,在肾脏发育中促进输尿管芽分支和肾小球形成。NPNT还参与骨骼发育、脂肪细胞分化等过程。研究表明,NPNT表达异常与慢性肾脏病、癌症、骨质疏松等疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
慢性肾脏病 NPNT表达下调可能影响肾小球滤过屏障,导致蛋白尿和肾功能进行性下降。 较强研究证据
肾发育异常 NPNT在肾脏发育中关键,其缺失可导致肾发育不全或异常。 已明确致病
骨质疏松 NPNT参与骨形成和骨重塑,其变异可能影响骨密度。 潜在关联
癌症 NPNT在多种肿瘤中表达异常,可能通过整合素信号影响肿瘤侵袭和转移。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
骨骼肌 暂无可靠数据 低表达
脂肪组织 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达低,常用于过表达研究
HK-2 暂无可靠数据 人肾近端小管上皮细胞,表达NPNT
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系,表达NPNT
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或功能,与慢性肾脏病相关
c.567del (p.Gly190ValfsTer23) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能功能丧失
c.890A>G (p.Asn297Ser) 错义突变 罕见 可能影响整合素结合,与骨质疏松相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致截短蛋白,可能影响NPNT的分泌或整合素结合能力。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576 (extracellular region) • GO:0005178 (integrin binding)
• GO:0007155 (cell adhesion) • GO:0001657 (ureteric bud development)
• GO:0005615 (extracellular space)

相关通路

Integrin signaling pathway (PID: integrin1)
Extracellular matrix organization (Reactome: R-HSA-1474244)

蛋白质功能简介

NPNT蛋白是一种分泌型细胞外基质蛋白,包含EGF样结构域和RGD基序。它通过与整合素α8β1结合,介导细胞-基质相互作用,参与肾脏发育、骨骼形成和脂肪细胞分化。NPNT在多种组织中表达,其异常表达与慢性肾脏病、骨质疏松和癌症相关。

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