NPRL3基因|基因功能、疾病关联、突变与疾病机制研究

NPRL3是GATOR1复合物的关键组分,调控mTORC1信号通路,其突变与癫痫和局灶性皮质发育不良相关。

基因信息卡

基因符号 NPRL3
基因全名 NPR3 like, GATOR1 complex subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 16p13.3
NCBI Gene ID 8131 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8131
Ensembl ID ENSG00000103168
UniProt ID Q12980
OMIM ID 614750
HGNC ID 7995
基因别名 CG1, MARE, NPRL3, C16orf35

基因功能与研究简介

NPRL3基因编码GATOR1复合物的一个亚基,该复合物是mTORC1信号通路的负调控因子。GATOR1复合物由NPRL2、NPRL3和DEPDC5组成,通过感知氨基酸水平调节mTORC1活性。NPRL3突变可导致mTORC1过度激活,与多种神经系统疾病相关,尤其是局灶性癫痫和局灶性皮质发育不良。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
家族性局灶性癫痫 NPRL3突变导致GATOR1功能丧失,mTORC1过度激活,影响神经元迁移和皮质发育,从而引发癫痫。 已明确致病
局灶性皮质发育不良 NPRL3突变导致mTORC1信号异常,引起皮质发育畸形,与癫痫相关。 已明确致病
其他神经系统疾病 NPRL3突变可能与其他神经系统疾病相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
c.1567_1568del (p.Leu523ValfsTer3) 移码突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致NPRL3蛋白功能丧失或截短,破坏GATOR1复合物稳定性,使mTORC1过度激活。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0034198 (mTORC1 signaling) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005829 (cytosol) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

mTOR signaling pathway (KEGG: hsa04150)
Regulation of mTORC1 signaling (Reactome: R-HSA-165159)

蛋白质功能简介

NPRL3蛋白是GATOR1复合物的亚基,与NPRL2和DEPDC5形成复合物,作为GATOR1复合物的支架蛋白,参与氨基酸感应和mTORC1信号通路的负调控。NPRL3蛋白包含一个NPRL2结合域和一个DEPDC5结合域,其功能丧失导致mTORC1过度激活,影响细胞生长和代谢。

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