NR2F1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NR2F1(COUP-TFI)是调控神经发育和代谢的关键转录因子,其突变与Bosch-Boonstra-Schaaf视神经萎缩综合征相关。

基因信息卡

基因符号 NR2F1
基因全名 Nuclear Receptor Subfamily 2 Group F Member 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q15
NCBI Gene ID 7025 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7025
Ensembl ID ENSG00000175745
UniProt ID P10588
OMIM ID 132890
HGNC ID 7975
基因别名 COUP-TFI, COUP-TF1, EAR3, ERBAL3, TFCOUP1

基因功能与研究简介

NR2F1(核受体亚家族2组F成员1)编码一种转录因子,属于核受体超家族,也称为COUP-TFI(鸡卵清蛋白上游启动子转录因子I)。该蛋白在神经发育、细胞分化和代谢调控中发挥关键作用。NR2F1通过结合DNA上的直接重复序列(DR)或回文序列来调节靶基因表达,参与大脑皮层、海马、基底节等区域的发育。NR2F1突变可导致Bosch-Boonstra-Schaaf视神经萎缩综合征(BBSOAS),表现为视神经萎缩、智力障碍和运动发育迟缓。此外,NR2F1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Bosch-Boonstra-Schaaf视神经萎缩综合征 NR2F1单倍剂量不足或功能丧失突变导致神经发育异常,表现为视神经萎缩、智力障碍和运动发育迟缓。 已明确致病
视神经萎缩 NR2F1突变导致视网膜神经节细胞发育异常,引起视神经萎缩。 已明确致病
智力障碍 NR2F1突变影响大脑皮层发育,导致认知功能障碍。 已明确致病
癌症 NR2F1在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
大脑皮层 暂无可靠数据 高表达
海马体 暂无可靠数据 高表达
小脑 暂无可靠数据 中等表达
视网膜 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
SK-N-SH 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质母细胞瘤细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.2T>C (p.Met1Thr) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.3G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.4A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.5T>C (p.Met1Thr) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.6G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.7A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.8T>C (p.Met1Thr) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.9G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.10A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

NR2F1突变导致蛋白功能丧失或单倍剂量不足,是BBSOAS的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明NR2F1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型蛋白功能,但证据有限。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity) • GO:0003707 (steroid hormone receptor activity)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0007275 (multicellular organism development) • GO:0007399 (nervous system development)
• GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

Retinoic acid receptor signaling pathway
Nuclear receptor transcription pathway
Neurogenesis

蛋白质功能简介

NR2F1蛋白(UniProt P10588)属于核受体超家族,包含一个DNA结合域和一个配体结合域。它作为转录因子,通过结合靶基因启动子区域的直接重复序列(DR)或回文序列来调节基因表达。NR2F1在神经发育中至关重要,调控大脑皮层、海马、基底节等区域的神经元分化、迁移和突触形成。此外,NR2F1还参与代谢调控,影响脂质和葡萄糖代谢。NR2F1突变导致蛋白功能丧失或单倍剂量不足,引起BBSOAS。

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