NSD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NSD1编码组蛋白甲基转移酶,参与基因转录调控,其功能异常与Sotos综合征及多种肿瘤相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NSD1 |
|---|---|
| 基因全名 | Nuclear Receptor Binding SET Domain Protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q35.3 |
| NCBI Gene ID | 64324 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64324 |
| Ensembl ID | ENSG00000165671 |
| UniProt ID | Q96L73 |
| OMIM ID | 606681 |
| HGNC ID | 14234 |
| 基因别名 | KMT3B, SOTOS, STO, PPP1R108 |
基因功能与研究简介
NSD1基因编码核受体结合SET结构域蛋白1,是一种组蛋白甲基转移酶,主要催化组蛋白H3第36位赖氨酸的二甲基化(H3K36me2),参与基因转录调控、DNA损伤修复和染色质重塑。NSD1功能异常与Sotos综合征(一种过度生长综合征)以及多种肿瘤的发生发展密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Sotos综合征 | NSD1单倍剂量不足或功能丧失突变导致H3K36me2水平降低,影响基因表达调控,导致过度生长、智力障碍等特征。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | NSD1重排(如NUP98-NSD1融合)导致组蛋白甲基转移酶活性异常,促进白血病发生。 | 具有较强研究证据 |
| 多发性骨髓瘤 | NSD1过表达或突变可能促进肿瘤细胞增殖,但具体机制尚在研究中。 | 潜在关联 |
| 神经母细胞瘤 | NSD1突变或表达异常与肿瘤发生相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.601C>T (p.Arg201Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1096C>T (p.Arg366Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4567G>A (p.Gly1523Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| NUP98-NSD1融合 | 基因重排 | 在AML中约5% | Gain of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,导致NSD1蛋白失活或截短,降低H3K36me2水平,影响基因表达调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,如NUP98-NSD1融合蛋白,可能增强甲基转移酶活性或改变底物特异性,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,可能干扰正常NSD1功能,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0008270 (zinc ion binding) |
| • GO:0018024 (histone H3K36 methyltransferase activity) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0006325 (chromatin organization) |
相关通路
• hsa00310 (Lysine degradation)
• hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)
蛋白质功能简介
NSD1蛋白包含SET结构域、PWWP结构域和多个锌指结构域,主要催化组蛋白H3K36me2。该修饰与转录延伸、DNA损伤修复和mRNA剪接相关。NSD1通过调控HOX基因等靶基因表达,参与发育和细胞分化。
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