NSMCE1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NSMCE1编码SMC5/6复合物的非结构维持组分,参与DNA损伤修复和基因组稳定性维持,其突变与多种癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NSMCE1 |
|---|---|
| 基因全名 | NSE1 Homolog, SMC5-SMC6 Complex Component |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 16p12.1 |
| NCBI Gene ID | 197370 ncbi.nlm.nih.gov/gene/197370 |
| Ensembl ID | ENSG00000130787 |
| UniProt ID | Q9H0I3 |
| OMIM ID | 617238 |
| HGNC ID | 29813 |
| 基因别名 | NSE1, FLJ12623, MGC126851 |
基因功能与研究简介
NSMCE1(NSE1 Homolog, SMC5-SMC6 Complex Component)编码SMC5/6复合物的一个亚基,该复合物在DNA损伤修复、复制应激应答和基因组稳定性维持中发挥关键作用。NSMCE1具有RING finger结构域,可能参与泛素化修饰。研究表明NSMCE1功能异常与多种癌症(如乳腺癌、肝癌)和发育异常(如小头畸形)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 小头畸形 | NSMCE1突变导致SMC5/6复合物功能受损,影响DNA修复和细胞增殖,可能引起神经发育异常。 | ClinVar, OMIM |
| 乳腺癌 | NSMCE1表达异常或突变可能影响基因组稳定性,增加癌症风险。 | COSMIC, 文献 |
| 肝细胞癌 | NSMCE1在肝癌中表达上调,可能通过调控DNA修复促进肿瘤进展。 | COSMIC, 文献 |
| 范可尼贫血样表型 | NSMCE1突变可能影响DNA交联修复,导致类似范可尼贫血的临床特征。 | OMIM, 文献 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.550C>T (p.Arg184Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能引起功能丧失 |
| c.682G>A (p.Glu228Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.1015A>G (p.Ile339Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使SMC5/6复合物功能丧失,影响DNA修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明NSMCE1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
某些错义突变可能产生异常蛋白,干扰复合物组装,产生显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0006281 (DNA repair) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) | • GO:0035861 (SMC5-SMC6 complex) |
相关通路
• Homologous recombination repair (GO:0000724)
• Fanconi anemia pathway (hsa03460)
• DNA damage response (hsa04216)
蛋白质功能简介
NSMCE1蛋白是SMC5/6复合物的非结构亚基,含有RING finger结构域,可能具有E3泛素连接酶活性。该复合物在DNA双链断裂修复、复制叉稳定和染色体分离中起重要作用。NSMCE1通过与SMC5、SMC6及其他NSE蛋白相互作用,参与DNA损伤应答和基因组稳定性维持。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|