NTRK1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NTRK1编码神经营养因子受体TrkA,在神经发育和疼痛感知中起关键作用,其突变可导致先天性无痛症和多种癌症。
基因信息卡
| 基因符号 | NTRK1 |
|---|---|
| 基因全名 | neurotrophic receptor tyrosine kinase 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1q23.1 |
| NCBI Gene ID | 4914 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4914 |
| Ensembl ID | ENSG00000198400 |
| UniProt ID | P04629 |
| OMIM ID | 191315 |
| HGNC ID | 8031 |
| 基因别名 | TRK1, TRKA, MTC, p140-TrkA, Trk-A |
基因功能与研究简介
NTRK1基因编码神经营养因子受体酪氨酸激酶1(TrkA),属于受体酪氨酸激酶家族。TrkA是神经生长因子(NGF)的高亲和力受体,在神经元的存活、分化和突触可塑性中发挥关键作用。NTRK1基因突变可导致先天性无痛症(CIPA)和多种癌症,如甲状腺乳头状癌、肺癌和结直肠癌等。此外,NTRK基因融合是多种实体瘤的驱动事件,针对NTRK融合的靶向药物(如拉罗替尼和恩曲替尼)已获批用于治疗NTRK融合阳性肿瘤。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性无痛症(CIPA) | NTRK1基因功能缺失突变导致TrkA受体失活,影响NGF信号通路,导致感觉神经元发育异常,表现为痛觉缺失、无汗和智力障碍。 | 已明确致病 |
| 甲状腺乳头状癌 | NTRK1基因重排(如TPM3-NTRK1)导致组成性激活的融合蛋白,激活下游信号通路,促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 肺癌 | NTRK1基因融合(如CD74-NTRK1)在非小细胞肺癌中作为驱动事件,激活致癌信号。 | 已明确致病 |
| 结直肠癌 | NTRK1基因融合(如LMNA-NTRK1)在结直肠癌中作为驱动事件,激活致癌信号。 | 已明确致病 |
| 其他实体瘤 | NTRK基因融合在多种实体瘤中均有发现,如肉瘤、唾液腺癌、婴儿纤维肉瘤等,是泛肿瘤靶点。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 背根神经节 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系,高表达 |
| PC12 | 暂无可靠数据 | 大鼠嗜铬细胞瘤细胞系,高表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系,低表达 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系,低表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.851C>T (p.Pro284Leu) | 错义突变 | 罕见 | 功能缺失,导致先天性无痛症 |
| c.1720C>T (p.Arg574Trp) | 错义突变 | 罕见 | 功能缺失,导致先天性无痛症 |
| TPM3-NTRK1融合 | 基因重排 | 在甲状腺乳头状癌中常见 | 功能获得,组成性激活 |
| CD74-NTRK1融合 | 基因重排 | 在肺癌中罕见 | 功能获得,组成性激活 |
| LMNA-NTRK1融合 | 基因重排 | 在结直肠癌中罕见 | 功能获得,组成性激活 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变:导致TrkA受体失活或表达降低,影响NGF信号通路,常见于先天性无痛症。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变:如基因融合或激活性点突变,导致TrkA组成性激活,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据表明NTRK1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004672 (protein kinase activity) | • GO:0004713 (protein tyrosine kinase activity) |
| • GO:0005524 (ATP binding) | • GO:0007169 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0042803 (protein homodimerization activity) |
| • GO:0030971 (growth factor receptor binding) |
相关通路
• hsa04722 (Neurotrophin signaling pathway)
• hsa04010 (MAPK signaling pathway)
• hsa04020 (Calcium signaling pathway)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
NTRK1编码的TrkA蛋白是一种跨膜受体酪氨酸激酶,由胞外配体结合域、跨膜域和胞内激酶域组成。TrkA与NGF结合后,诱导受体二聚化和自磷酸化,激活下游信号通路,如Ras/MAPK、PI3K/AKT和PLCγ,从而调节神经元的存活、分化和突触可塑性。在肿瘤中,NTRK基因融合导致TrkA激酶域组成性激活,驱动细胞增殖和存活。
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