NUMB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NUMB基因编码一种关键的细胞命运决定因子,通过调控Notch信号通路和p53稳定性,在神经发育、肿瘤发生及多种疾病中发挥重要作用。
基因信息卡
| 基因符号 | NUMB |
|---|---|
| 基因全名 | NUMB endocytic adaptor protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q24.2-q24.3 |
| NCBI Gene ID | 8650 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8650 |
| Ensembl ID | ENSG00000133961 |
| UniProt ID | P49757 |
| OMIM ID | 603728 |
| HGNC ID | 8060 |
| 基因别名 | S171; c14orf39; NUMB-LIKE |
基因功能与研究简介
NUMB基因编码一种进化上保守的衔接蛋白,最初在果蝇中被发现,是细胞命运决定的关键调控因子。NUMB蛋白通过内吞途径调控Notch信号通路,并参与p53的泛素化降解,从而影响细胞增殖、分化和凋亡。在哺乳动物中,NUMB在神经发育、肌肉再生和肿瘤抑制中发挥重要作用。NUMB的异常表达或突变与多种癌症(如乳腺癌、肺癌、胶质瘤)及神经系统疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | NUMB表达下调或功能缺失导致Notch信号过度激活,促进肿瘤发生和进展。 | 已明确致病 |
| 非小细胞肺癌 | NUMB表达降低与不良预后相关,可能通过调控p53和Notch通路影响肿瘤生长。 | 具有较强研究证据 |
| 胶质瘤 | NUMB表达缺失或突变导致Notch信号异常,促进胶质瘤干细胞自我更新和肿瘤生长。 | 具有较强研究证据 |
| 精神分裂症 | NUMB基因多态性与精神分裂症风险相关,可能影响神经发育和突触功能。 | 潜在关联 |
| 阿尔茨海默病 | NUMB参与淀粉样前体蛋白(APP)的加工,可能影响Aβ的产生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肌肉 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| U87MG | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.174C>T (p.Arg58Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1129A>G (p.Thr377Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或功能 |
| c.1573C>T (p.Arg525Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响Notch结合能力 |
| c.1966G>A (p.Val656Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白定位或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):如无义突变导致截短蛋白,或错义突变影响关键功能域,导致NUMB蛋白功能缺失或降低,从而解除对Notch信号的抑制,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前尚无明确证据表明NUMB存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):某些错义突变可能产生具有干扰野生型NUMB功能的蛋白,但具体证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005768 endosome |
| • GO:0005886 plasma membrane | • GO:0007219 Notch signaling pathway |
| • GO:0043065 positive regulation of apoptotic process | • GO:0045892 negative regulation of transcription |
| • DNA-templated |
相关通路
• Notch signaling pathway (hsa04330)
• Endocytosis (hsa04144)
• p53 signaling pathway (hsa04115)
蛋白质功能简介
NUMB蛋白是一种衔接蛋白,包含一个磷酸酪氨酸结合(PTB)结构域和多个富含脯氨酸的区域。它通过PTB结构域与Notch受体胞内域结合,促进Notch受体内吞和降解,从而负调控Notch信号通路。此外,NUMB还能与p53结合并促进其泛素化降解,从而影响细胞凋亡和细胞周期。NUMB在细胞分裂过程中不对称分布,决定子代细胞的命运。在多种癌症中,NUMB表达下调或功能缺失导致Notch信号过度激活,促进肿瘤干细胞的自我更新和肿瘤生长。
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