NUP188基因|核孔复合体功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NUP188是核孔复合体的重要组成部分,参与核质运输和细胞分裂,其突变与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NUP188 |
|---|---|
| 基因全名 | nucleoporin 188 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q34.11 |
| NCBI Gene ID | 23511 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23511 |
| Ensembl ID | ENSG00000119326 |
| UniProt ID | Q5SRE5 |
| OMIM ID | 618570 |
| HGNC ID | 17859 |
| 基因别名 | KIAA0169, FLJ10534 |
基因功能与研究简介
NUP188基因编码核孔复合体(NPC)的一个亚基,该蛋白位于核孔复合体的核质侧,参与核质运输、细胞分裂和基因表达调控。NUP188在多种组织中表达,其功能异常与某些疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性心脏病 | NUP188突变可能导致心脏发育异常,具体机制尚在研究中。 | ClinVar |
| 小头畸形 | 有报道NUP188突变与神经发育异常相关,但证据有限。 | ClinVar |
| 癌症 | NUP188在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体作用需进一步研究。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.4567C>T (p.Arg1523Ter) | 无义突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变可能导致蛋白功能丧失,影响核孔复合体组装或功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005643 (nuclear pore) | • GO:0005487 (nuclear pore complex) |
| • GO:0006810 (transport) | • GO:0006997 (nucleus organization) |
相关通路
• Nuclear Pore Complex (NPC) assembly
• Nucleocytoplasmic transport
蛋白质功能简介
NUP188蛋白是核孔复合体的一个亚基,分子量约188 kDa。它参与核孔复合体的组装和稳定,以及核质运输的调控。NUP188在细胞分裂中也有作用,可能参与纺锤体组装检查点。